1994 Fiscal Year Annual Research Report
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06740596
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| Research Institution | Nagoya University |
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Principal Investigator |
若杉 達也 名古屋大学, 遺伝子実験施設, 助手 (10212317)
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| Keywords | RNAエディティング / 遺伝子発現 / 葉緑体ゲノム / 裸子植物 / クロマツ |
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| Research Abstract |
裸子植物のクロマツの葉緑体においてRNAエディティングが起きているかどうかを検証するために、コンピューター解析から予想されたエディティング部位を含む断片をクロマツの全DNAと全RNAから合成したcDNAからPCRによって増幅した。それらのDNAとcDNAの断片の塩基配列を決定し、両者の間で比較した。その結果、解析した10種のクロマツ葉緑体遺伝子(atpA、atpF、petD,petG、psaB、psbB、rps14、ORF62、ORF320)の前駆体RNAにおいて、24ヶ所でRNAエディティングが起きていることが明らかとなった。そのRNAエディティングのタイプはすべてC→U変換によるものだった。RNAエディティングによるコドンの変化のパターンは、これまで被子植物の葉緑体ではコドンの2文字目が変化するのがほとんどであったのに対し、クロマツではコドンの1文字目が変化している例が多くみられ、被子植物葉緑体では報告のなかったタイプのコドン置換も7種見つかった。それらのなかで特殊なものとして終止コドンが形成される例が2例(petD、ORF62)見つかった。なかでもORF62についてはRNAエディティングによって開始コドンと終止コドンの両方が形成されることにより、ORF62から植物間で保存されたサイズのORF33に変化することが明らかになった。このような例は動植物をつうじて初めての報告である。以上のように裸子植物のクロマツにおいて葉緑体でのRNAエディティングの機構が獲得されていること、そのRNAエディティングのパターンは被子植物のものとは異なっていることが明らかとなった。
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[Publications] Tatsuya Wakasugi: "Loss of all ndh genes as determined by sequencing the entire chloroplast genome of black pine,Pinus thunbergii" Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 91. 9794-9798 (1994)
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[Publications] Tatsuya Wakasugi: "A physical map and clone bank of the black pine(Pinus thunbergii)chloroplast genome." Plant Mol.Biol.Rep.12. 227-241 (1994)
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[Publications] Tetsuro Hirose: "RNA editing of tobacco petB mRNAs occurs both in chloroplasts and non-photosynthetic proplastids." Plant Mol.Biol.26. 509-513 (1994)
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[Publications] Junko Tsudzuki: "A gene encoding tRNA^<Pro>(GGG) is present in the chloroplast genome of black Pine:a complilation of 32 tRNA genes from black pine chloroplast" Curr.Genet.26. 153-158 (1994)
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[Publications] Sanjay Kapoor: "An atpE spexific promoter within the coding region of atpB gene in tobacco chloroplast DNA." Curr.Genet.26. 263-268 (1994)
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[Publications] Masakazu Fukuta: "Nucleotide sequence of a putative sensovy kinase gene from the cyanobacterium,Anacystis nidulans 6301" DNA Res.1. 99-100 (1994)
