アブラナ科自家不和合性関連遺伝子の相同S遺伝子系統内でのDNA塩基配列の変異

1994 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 06760005
• Research Institution: Tohoku University
• Principal Investigator: 渡辺 正夫 東北大学, 農学部, 助手 (90240522)
• Keywords: アブラナ科植物 / 自家不和合性 / S遺伝子 / 遺伝的変異 / アミノ酸置換 / SLG遺伝子

Research Abstract

S24(1-1j)とS24(27-1t)の柱頭からcDNAライブラリーを作製し、SLG24(S-12j)をプローブとして、SLGのクスリ-ニングを行った。ORFの全長を含むクローンを両系統から1クローンずつ選び、全塩基配列を決定した。
今回スクリーニングして得られたSLG24(1-1j)とSLG24(27-1t)の間で比較したところ、ORFでは完全に一致していた。しかし、これらの塩基配列は、以前クローニングされていたSLG24(S-12j)と比較すると、6か所の置換および3か所の挿入があることがわかった。
推定したアミノ酸配列を比較したところ、塩基置換のうち3か所は同義的置換であり、残りの3か所は非同義的置換であった。さらに、SLG24(S-12j)には存在しない塩基がSLG24(1-1j)とSLG24(27-1t)において確認された。これらの塩基の挿入はお互いに近いところで起こっているため、この挿入によってアミノ酸配列が大幅に変化していなかった。
このように変異が認められたものの、地理的に離れた集団であるS24(1-1j)とS24(27-1t)のSLGの間では塩基配列が一致し、同じ集団から時を異にしてサンプリングされたS24(S-12j)とS24(1-1j)のSLGの間では異なっているのは不自然であると考え、S24(S-12j)の個体から、ゲノムDNAを抽出し、SLGに特異的なプライマーのペアを用いてPCRを行い、増幅されたSLG断片をクローニングした。
このクローンの両端からのシークエンスを行った結果、以前報告されていたSLG24(S-12j)の配列とは異なり、SLG24(1-1j)とSLG24(27-1t)と同じ塩基配列を示した。このことから、S24の3系統のSLGの塩基配列は全て同じである可能性が考えられ、このことを確認するため現在解析中である。

Research Products

• [Publications] 松下真紀: "Brassica campestrisの同一S遺伝子系統内におけるSLGの塩基置換" 育種学雑誌. 44(別2). 32-32 (1994)
• [Publications] Masanori Matsushita: "Base sequence oariation of the S-glycoprotein within the same S^<12>-allele in Brassica compestnis." “Pollen-pistal interactions and pollen tube growth"ed.by A.G.Stephensor ThKaO.Current Topicsin Plant Physiology:. 12. 313-315 (1994)