PEBP-2のDNA結合:ヘテロダイマー形成の構造学的研究

1994 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 06780534
• Research Institution: Osaka University
• Principal Investigator: 白川 昌宏 大阪大学, たんぱく質研究所, 助手 (00202119)
• Keywords: NMR / DNA結合蛋白質 / 立体構造解析 / PEBP2 / 転写制御 / ヘテロダイマー

Research Abstract

本研究ではマウス・ポリオーマ・ウイルス・エンハンサー結合蛋白質-2(PEBP2)αサブユニットのDNA結合ドメインなどの溶液中での立体構造を核磁気共鳴法で決定し、加えてDNAと複合体の解析も進めることによって、DNA塩基配列の認識機構を立体構造に基づいて明らかにすることを目的とした。
今年度はマウス・ポリオーマ・ウイルス・エンハンサー結合蛋白質-2(PEBP2)αサブユニットに関してはDNA結合と βサブユニットとのヘテロダイマー形成能を持つ139残基からなるドメインについて、融合蛋白質を利用した大量産製システムを導入し、NMR測定に必要な量の試料を調整することが出来るようになった。PEBP2についてはすでに水素核-窒素核相関2次元NMRスペクトル測定を既に行っている。また、ドメイン中に2つあるCys残基の少なくとも一つをGlyに変異したものは結合活性や安定性が顕著に上昇していることが、共同研究者である重定博士らによって明らかにされているので、その変異体の大量産製システムも構築しようとしている。
このPEBP2αのDNA結合ドメイン、βとのヘテロダイマードメインとも立体構造的には殆ど明らかになっておらず、また既知のDNA結合モチーフを持つとは考えられていない。またβドメインはDNA結合に直接関わっていないにも関わらず、ヘテロダイマーではDNA結合が強められると言う構造学上興味深い現象を示す。従って、これらの立体構造決定をする事によって新しいDNA塩基配列認識の構造モチーフを見つけだせることが期待できる。

Research Products

• [Publications] H.Asahina: "The XPA protein is a zinc metalloprotein with an ability to recognize various kinds of DNA damage" Mutation Research. (in press).
• [Publications] E.H.Morita: "Structure of the Oct-3 POU-homeodomain in Solution,as Determined by Triple Resonance Heteronclear Multidimensional NMR Spectroscopy" Protein Science. (in press).
• [Publications] M.Shirakawa: "The use of heteronuclear cross polarization for backbone assignment of 2H,15Nand 13C-labeled proteins ; A pulse scheme for triple resonance 4D ccrreletior of sequential amide proton and nitrogen-15" J.Biomol.NMR. (in press).
• [Publications] K.Uegaki: "Unique Structure of the DNA Binding Domain of Interferon Regulatory Factor 2 Determined by NMR Spectroscopy" Proceedings of the Japan Academy. 70B. 200-204 (1994)
• [Publications] K.Uegaki: "Secondary structure and folding topology of the DNA binding domain of interferon regulatory factor 2,as reveraled by NMR soectroscopy" FEBS Letters. 359. 184-188 (1995)