• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to project page

2006 Fiscal Year Annual Research Report

遺伝的プログラミングのバイオ情報処理への応用

Research Project

Project/Area Number 06F06097
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

伊庭 斉志  東京大学, 大学院新領域創成創成科学研究科, 教授

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) VENET David  東京大学, 大学院新領域創成創成科学研究科, 外国人特別研究員
Keywords遺伝的プログラミング / 遺伝子ネットワーク / 遺伝的アルゴリズム / 進化計算 / 遺伝子解析 / システム生物学 / ネットワーク解析 / DNAマイクロアレイ
Research Abstract

本研究は、マイクロアレイデータで得られた発現データからの遺伝子ネットワークの推定を目的とする。とくに、複数の異種モデルを用いることを前提として、集団学習のアプローチによりモデルを統合してより頑強な推定手法を構築する。具体的には、異種モデルの推定結果を動的(競合的)に組み合わせる一方で、静的(協調的)に統合して新たな推定と仮説を生成する。またバギングやブースティングなどの機械学習の手法により、与えられたマイクロアレイデータからブートストラップ法(例題からの復元抽出)を繰り返して擬似的にデータ(仮説)を作り、複数の機械を独立に学習し、多数決により頑強な学習手法を確立することを試みた。
研究代表者は分担者(David Venet)と協力して、(1)S-systems,(2)重み付けネット,(3)微分方程式系,(4)確率微分方程式,(5)ベイジアンネットのそれぞれのモデルに関しての遺伝子ネットワークの推定の研究を行い、遺伝的アルゴリズムを用いた推定手法を提案し、国際会議で発表するなどの成果をあげた。たとえば、遺伝子ネットワークの推定に関して、第17回ゲノム情報処理に関する国際会議(The 17th International Conference on Genome Informatics, GIW2006)において、"Meta Clustering : Discovery of the Different Sample Clusterings in Gene Expression Data"と題する発表を行った。この技法の新規さと有効性が評価され、最優秀論文賞を受賞した。

  • Research Products

    (4 results)

All 2007 2006

All Journal Article (3 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] ベイジアンネットワーク推定による確率モデル遺伝的プログラミング2007

    • Author(s)
      長谷川 禎彦, 伊庭 斉志
    • Journal Title

      人工知能学会論文誌 22・1

      Pages: 37-47

  • [Journal Article] マルチエージェント協調作業のためのランダムサンプリングを用いた経路プランニングアルゴリズム2006

    • Author(s)
      神尾 正太郎, 伊庭 斉志
    • Journal Title

      電子情報通信学会論文誌 J89-D・2

      Pages: 250-260

  • [Journal Article] 免疫系を用いた遺伝的プログラミングによる多峰性探索2006

    • Author(s)
      長谷川 禎彦, 伊庭 斉志
    • Journal Title

      人工知能学会論文誌 21・2

      Pages: 176-183

  • [Book] 複雑系のシミュレーション:Swarmによるマルチ・エージェントシステム2007

    • Author(s)
      伊庭斉志
    • Total Pages
      200
    • Publisher
      コロナ社

URL: 

Published: 2008-05-08   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi