1996 Fiscal Year Annual Research Report
Phytoplasmaの起源は植物か昆虫か-その分子進化学的新展開
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07456026
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
難波 成任 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (50189221)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
魯 暁云 日本学術振興会, 特別研究員
石川 幸男 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教授 (60125987)
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| Keywords | ファイトプラズマ / 16SrRNA遺伝子 / CTAB / Bootstrap |
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| Research Abstract |
今年度は、ファイトプラズマ(phytoplasma)の分子進化学的解析を行い、ゲノム解析および分子診断システムの確立を目的に研究を行った。まず、各種ファイトプラズマ分離株を集め、そのゲノムをCTAB法により精製し、PCRにより16SrRNA遺伝子を増幅し、ダイレクトシークエンシングにより全塩基配列を決定した。また、大型コンピュータのデータベースをもとに、海外のファイトプラズマを含む他の微生物の16SrRNA遺伝子の最新の配列データを検索し、先に得られた塩基配列データとの比較を行った。すなわち、大型解析プログラム「ODEN」により分子系統樹を構築し、「Bootstrap」を行い信頼性を解析した。得られた解析データをもとに、ファイトプラズマの分類体系を確立した。以上の解析データと分類体系をもとに、ファイトプラズマに「種」の分類を適用し、その判別に最適な「種」特異的プライマーをデザイン・合成した。合成したプライマーを用いて各々の「種」特異的PCRを行い、アジア各地の未知のファイトプラズマ分離株の分類を試みた。
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Research Products
(2 results)
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[Publications] 難波成任: "MLOからファイトプラズマへ-ファイトプラズマの分類" 植物防疫. 50・4. 30-34 (1996)
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[Publications] Sato,M.,Namba,S.,Katsuhara,M,Kawakita,H.,Mitsuhashi,W & Kawabe,S:"PCR(Polymerase Chain Reaction)Detection of Phytoplasema in Phloem Sap Collected by Laser Stylectomy" 日本植物病理学会報. 62・2. 177-180 (1996)
