ヒトカリシウイルス札幌株関連ウイルス群のRNAポリメラーゼ領域の変異に関する研究

1996 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 07670881
• Research Institution: Sapporo Medical University School of Medicine
• Principal Investigator: 中田 修二 札幌医科大学, 医学部, 講師 (70155745)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 古川 圭子 札幌医科大学, 医学部, 助手 ; 足立 憲昭 札幌医科大学, 医学部, 助手
• Keywords: ヒトカリシウイルス / genogroup III(札幌型) / RNAポリメラーゼ領域の変異 / シークエンス / ELISA法 / Dot Blot Hybridization法

Research Abstract

現在ヒトカリシウイルス(HuCV:human calicivirus)は遺伝子学的に、ノ-ウオ-クウイルス、スノーマウンテンウイルス、札幌型ヒトカリシウイルスを代表とするgenogroupI、II、IIIの3群に分類されている。それぞれの群の間では、RNA dependent RNA polymerase(RDRP)領域における核酸レベルでのホモロジーは70%以下であり、抗原性においても共通性はほとんどみられない。
札幌型HuCVを検出するEIA法で陽性であった検体のRDRP領域のsequence分析は、昨年度までにほとんど終了し、流行例、散発例を問わずプロトタイプと比較すると、核酸レベルで90-99%、アミノ酸レベルで98%以上と高いホモロジーが認められた。即ちELISA法で検出される程度の共通抗原性を有しているHuCVでは、RDRP領域における核酸およびアミノ酸配列はよく保存されていること、少なくとも10年間に渡って札幌型のHuCVが札幌市内及び近郊で保存されていることが判明した。
検出された全ての札幌型HuCVについてRDRP領域のシークエンスを行う替わりに、RDRP領域をプローブとしたdot blot hybridization法を作成した。特異性は高く、他の胃腸炎ウイルスや腸管系ウイルスは全て陰性であった。感度もcDNAで10pg/dotまたはウイルス粒子で10^5/dotと、EIA法よりはわずかに感度が低いものの、電顕法よりは高かった。ネコカリシウイルスとヒトgenogroupIのプロトタイプであるノ-ウオ-クウイルスは陰性で、genogroupIIは検討していないものの、genogroupIIIに特異的な検出法と考えられた。本法を用いて1987年から1990年にかけて採取された、電顕上SRSVが陽性であった100検体を検索したところ、21検体が陽性であった。一方、EIA法では10検体が陽性で、そのなかで8検体がdot法でも陽性であった。従って、dot法はHuCVの疫学的研究や分子生物学的研究の有用な手段になることが期待される。

Research Products

• [Publications] Nakata S: "The epidemiology of human calicivirus/Sapporo/82/J." Arch.Virol.[suppl]12. 263-270 (1996)
• [Publications] Kogawa K: "Dot blot hybridization with a cDNA probe derived from the human calicivirus Sapporo 1982 strain." Arch.Virol.141. 1949-1959 (1996)