1996 Fiscal Year Annual Research Report

FISH法を用いた実験動物のゲノム解析技術の開発と比較ゲノム地図の作製

Research Project

Project/Area Number	07680926
Research Institution	Nagoya University
Principal Investigator	松田洋一名古屋大学, 農学部, 助教授 (70165835)
Keywords	FISH / cDNA / 染色体マッピング / 染色体地図 / マウス / ラット / ハムスター / スンクス
Research Abstract	昨年度までにすでに完成し、実用段階に達した齧歯類染色体のダイレクトR-バンディングFISH法を用いて、マウス、ラット、ハムスターの機能遺伝子の染色体マッピングを行った。この二年間にマッピングされた機能遺伝子の総数は、マウス、ラット、ハムスターでそれぞれ、121、70、46遺伝子であり、ダイレクトR-バンディングFISH法を用いることによって極めて迅速に染色体マッピングを行うことが出来た。マウスcDNAクローンを用いた異種間の染色体マッピング効率は、マウス-ラット間で98%以上、マウス-シリアンハムスター間で91%以上と非常に高く、マウスcDNAクローンがラット、ハムスター染色体へのFISHマッピングに非常に有用であることが判明した。本研究によって、未だ機能遺伝子の染色体地図が存在しないシリアンハムスターにおいて、マウス染色体との間に16の染色体相同領域が同定され、FISH法が実験動物の比較染色体地図の作製に非常に有用であることが示された。また、本研究でラット染色体上にマップされた機能遺伝子の数(70)は、1994年度までにマップされたラット遺伝子の総数169の約2.5分の1という迅速さであった。さらに、新たに食虫類に属するスンクス(Suncus murinus)においてもダイレクトR-バンディングFISH法による高精度染色体マッピングシステムの確立を試みた。その結果、スンクスにおいても良好なreplicatio R-bandが得られ、ヒト、マウス、ラットのcDNAクローンを用いて、機能遺伝子を直接スンクス染色体にFISH法でマッピング出来たことから、今後は、この方法を用いて、スンクスにおいても機能遺伝子の染色体地図が迅速に作製されていくものと思われる。

Research Products

(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] Suzuki,H.,Sakurai,S.& Matsuda,Y.: "Rat 5S rDNA spacer sequences and chromosomal assignment of the gene to the extreme terminal region of chromosome 19" Cytogenetics and Cell Gentics. 72. 1-4 (1996)
[Publications] Matsuda,Y.et al: "Chromosome mapping of human (ZNF179),mouse and rat genes for brain finger protein (bfp),a member of the RING finger protein" Genomics. 33. 325-327 (1996)
[Publications] Matsuda,Y.et al: "Comparative genome mapping of ataxia telangiectasia region in the mouse,rat and hamster" Genomics. 34. 347-352 (1996)
[Publications] Matsuda,Y.et al: "Comparative mapping of the reeler gene on human chromosome 7q22,rat chromosome 4q11.2 and mouse chromosome 5A3-B1" Mammalian Genome. 7. 468-469 (1996)
[Publications] Matsuda,Y.et al: "Chromosomal assignment of the Bc12-related genes,Bcl2l abd Bax,in the mouse and rat" Cytogenetics and Cell Genetics. 74. 107-110 (1996)
[Publications] Takada S.,Okazaki,Y.& Matsuda,Y.: "Exclusion of candidate genes for hamster cardiomyopathy by FISH analysis" DNA Research. 3. 273-276 (1996)
[Publications] 松田洋一(分担): "染色体のin situハイブリダイゼーション,「組織培養の技術第3版」" 朝倉書店, 11 (1996)

1996 Fiscal Year Annual Research Report

FISH法を用いた実験動物のゲノム解析技術の開発と比較ゲノム地図の作製

Principal Investigator

松田 洋一 名古屋大学, 農学部, 助教授 (70165835)

Research Products

[Publications] Suzuki,H.,Sakurai,S.& Matsuda,Y.: "Rat 5S rDNA spacer sequences and chromosomal assignment of the gene to the extreme terminal region of chromosome 19" Cytogenetics and Cell Gentics. 72. 1-4 (1996)

[Publications] Matsuda,Y.et al: "Chromosome mapping of human (ZNF179),mouse and rat genes for brain finger protein (bfp),a member of the RING finger protein" Genomics. 33. 325-327 (1996)

[Publications] Matsuda,Y.et al: "Comparative genome mapping of ataxia telangiectasia region in the mouse,rat and hamster" Genomics. 34. 347-352 (1996)

[Publications] Matsuda,Y.et al: "Comparative mapping of the reeler gene on human chromosome 7q22,rat chromosome 4q11.2 and mouse chromosome 5A3-B1" Mammalian Genome. 7. 468-469 (1996)

[Publications] Matsuda,Y.et al: "Chromosomal assignment of the Bc12-related genes,Bcl2l abd Bax,in the mouse and rat" Cytogenetics and Cell Genetics. 74. 107-110 (1996)

[Publications] Takada S.,Okazaki,Y.& Matsuda,Y.: "Exclusion of candidate genes for hamster cardiomyopathy by FISH analysis" DNA Research. 3. 273-276 (1996)

[Publications] 松田洋一(分担): "染色体のin situハイブリダイゼーション,「組織培養の技術 第3版」" 朝倉書店, 11 (1996)

松田洋一名古屋大学, 農学部, 助教授 (70165835)

[Publications] 松田洋一(分担): "染色体のin situハイブリダイゼーション,「組織培養の技術第3版」" 朝倉書店, 11 (1996)