1996 Fiscal Year Annual Research Report
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08044320
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| Research Institution | Keio University |
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Principal Investigator |
清水 信義 慶応義塾大学, 医学部, 教授 (50162706)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
MCDERMID He アルバータ大, 医学部, 教授
KOLA Ismail モナシュ大, 生殖発生研, 教授
ANTONARAKIS スティリアノス ジュネーブ大, 医学部, 教授
EMANUEL Bev ペンシルベニア大学, 医学部, 教授
浅川 修一 慶大, 医学部, 助手 (30231872)
川崎 和彦 慶大, 医学部, 助手 (90245465)
工藤 純 慶大, 医学部, 助手 (80178003)
蓑島 伸生 慶大, 医学部, 講師 (90181966)
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| Keywords | 心臓障害 / ダウン症候群 / エキソントラッピング / コスミドクローン / SIM2遺伝子 / トランスジェニックマウス / BACクローン / 猫目症候群 |
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| Research Abstract |
心臓障害に関する遺伝子はダウン症関連では21番染色体の特定領域(D21S55-CRYA1)に存在すると推定されている。この領域に相当するコスミドクローンをCEPHの整列YACクローンを用いて多数分離し、YAC同士の重なりを利用して19のサブ領域に分類した。各領域ごとのコスミドDNAを用いてエキソントラッピングを行ない163個のエキソンを単離してそれぞれシーケンスを決定した。得られたエキソンのシーケンスについて各種データベースを用いてホモロジー検索した結果、いくつかの既知遺伝子(HCS、ERG)と新規遺伝子(SIM2、MNB,GIRK2)が同定できた。SIM2遺伝子に関してはアントナラキス教授との共同研究を進め、cDNAの全構造と発現のパターンを決定し、続けて独自にゲノムDNAの全構造も決定した。さらに、SIM2遺伝子(約90kb)の全長を含むBACクローンを単離し、それを用いたトランスジェニックマウスの作製に関してコーラ教授と具体的計画を検討し立案を行なった。また、137個のエキソンに特異なプライマーを作製して各種臓器特異的cDNAライブラリーをスクリーニングしたところ、胎児の心臓に特異的に発現するエキソン1個を見いだした。現在、これに関しても全長cDNAの単離を進めている。
一方、猫目症候群での心臓障害関連領域22q11.2に相当するコスミドクローンやBACクローンをスクリーニングし、それらを用いてマックダ-ミッド教授のチームがエキソントラッピングを進めており、すでに新規エキソンを含むcDNAクローン(5kb)のシーケンスを解析中である。研究の進捗状況を討議し効率よく進めるため、マックダ-ミッド教授を招へいして詳しい意見交換を行なった。
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[Publications] Osoegawa, K.: "An Integrated Map with Cosmid/PAC Contigs of a 4-Mb Down Syndrome Critical Region" Genomics. 32 (3). 375-387 (1996)
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[Publications] Yamaki, A.: "The Mammalian single-minded (SIM) Gene ; Mouse cDNA Structure and Diencephalic Expression Indicate a Candidate Gene for Down Syndrome" Genomics. 35 (1). 136-143 (1996)
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[Publications] Shindoh, N.: "Cloning of a Human Homolog of the Drosophila Minibrain/Rat Dyrk Gene from "the Down Syndrome Critical Region" of Chromosome 21" Biochem. Biophys. Res. Commun.225 (1). 92-99 (1996)
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[Publications] Nagamine, K.: "Isolation of cDNA for a Novel Human Protein KNP-I that is Homologous to the E. coli SCRP-27A Protein from the Autoimmune Polyglandular Disease Type I(APECED) Region of Chromosome 21q22.3" Biochem. Biophys. Res. Commun.225 (2). 608-616 (1996)
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[Publications] Murataka, T.: "Structural Organization and Chromosomal Assignment of the Human 13-3-3η Chain Gene (YWHAH)" Genomics. 36 (1). 63-69 (1996)
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[Publications] Wang, Y.: "Chromosomal Mapping of a Family of Human Glutamine Synthetase Genes : Functional Gene (GLUL) on 1q25, Pseudogene (GLULP) on 9p13 and Three Related Genes (GLULL1, GLULL2, GLULL3) on 5q33, 11p15 and 11p24" Genomics. 37 (2). 195-199 (1996)
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[Publications] Kwasaki, K.: "One Megabase Sequence Analysis of the Human Immunoglobulin λ Gene Locus" Genome Res.7 (3). 250-261 (1997)
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[Publications] Imamur, Y.: "Human Retina-specific Amine Oxidase (RAO) : cDNA Cloning, Tissue Expression and Chromosomal Mapping" Genomics. (in press).
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[Publications] Asakawa, S.: "Human BAC Libraly : Construction and Rapid Screening" Gene. (in press).
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[Publications] Kubota, R.: "A Nobel Myosin-like Protein (Miocilin) Expressed in Connecting Cilium of Photoreceptor : Molecular Cloning, Tissue Expression and Chromosomal Mapping" Genomics. (in press).
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[Publications] Kudoh, J.: "Localization of 16 Exons to a 450-kb Region Involved in the Autoimmune Polyglandular Disease Type I (APECED) on Human Chromosome 21q22.3" DNA Res.(in press).
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[Publications] Antonarkis, S. E.: "Report of the Committee on the Genetic Constitution of Chromosome 21 In "Human Gene Mapping 1995" (eds) Cuticchia, A. J. et al." The Johns Hopkins Univ. Press, 40 (1996)
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[Publications] Minoshima, S.: "A Network-Transparent Database System for Mutations in the Human Disease Genes, In Proceedings Genome Informatics Workshop 1996" Universal Acadeny Press, Inc., 2 (1996)
