PCRダイレクトシーケンス法の改良および絶滅種を含む哺乳類進化の分子系統学的解析

1996 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 08257201
• Research Institution: Hokkaido University
• Principal Investigator: 増田 隆一 北海道大学, 理学部, 助手 (80192748)
• Keywords: 分子進化 / 哺乳類 / ミトコンドリアDNA / 絶滅種 / マンモス / リス科 / ニホンジカ / 分子系統樹

Research Abstract

本年は,3年間の研究計画の最終年度であり,以下の成果が得られた.
(1)シベリア永久凍士から発掘された約2万5千年前のマンモス組織から,DNA抽出と遺伝子増幅(PCR)に成功した.そして,ミトコンドリアDNAのチトクロームb遺伝子および12SリボソームRNA遺伝子の全領域について,塩基配列を決定することができた.また,現生のアフリカゾウならびにアジアゾウについても同様に塩基配列を決定した.これらの塩基配列に基づき,塩基置換および分子系統樹を検討したところ,上記のゾウ亜科3種はお互いに近いが,マンモスはアジアゾウよりもアフリカゾウにより近縁であることが示唆された.
(2)リス科齧歯類において,ムササビ・モモンガなど被膜をもったグループが単系統群であるかどうかを追及するため,ミトコンドリアDNAのチトクロームb遺伝子ならびに12SリボソームRNA遺伝子領域の分子系統学的解析を行った.その結果、両遺伝子の特徴は共に,被膜をもつムササビ・モモンガのグループが単系統であることを支持した.
(3)ニホンジカについて,D-loop領域の全塩基配列を決定し、その地理的変異を検討した.その結果,偶蹄類の中でもニホンジカに特異的な繰り返し配列を検出した.その繰り返し数はそれぞれの地域に特異的であった.さらに,塩基配列全体の比較により,北日本(北海道,本州を含む)グループと南日本(九州および周辺の島々を含む)グループの間に遺伝的分化があることが明らかになった.また,北海道のニホンジカ集団(エゾシカ)には,少なくとも6つのD-loopタイプが存在し,その分布パターンが北海道における植生と深く関与していることが示唆された.

Research Products

• [Publications] Ryuichi Masuda: "Molecular phylogeny of mitochondrial cytochrome b and 12S rRNA sequences in the Felidae : Ocelot and domestic cat lineages." Molecular Phylogenetics and Evolution. 6. 351-365 (1996)
• [Publications] Tatsuo Oshida: "Phylogenetic relationships among Japanese species of the family Sciuridae (Mammalia, Rodentia), inferred from nucleotide sequences of mitochondrial 12S ribosomal RNA genes." Zoological Science. 13. 615-620 (1996)
• [Publications] Koichi Murata: "Gender determination of the Linne's two-toed sloth (Choloepus didactylus) using SRY amplified from hair." Journal of Veterinary Medical Science. 58. 1157-1159 (1996)
• [Publications] 増田隆一: "遺伝子からみたイリオモテヤマネコとツシマヤマネコの渡来と進化起源." 地学雑誌. 105. 354-363 (1996)
• [Publications] 村田浩一: "ラッコ新生仔の胎盤および臍帯DNAからのSRY遺伝子検出による性判別." 動物園水族館雑誌. 38. 48-51 (1996)