1996 Fiscal Year Annual Research Report

ペプチドライブラリーを用いたMHC‐ペプチド複合体の相補的安定化要因の解析

Research Project

Project/Area Number	08272212
Research Institution	Kyoto University
Principal Investigator	宇高恵子京都大学, 大学院・理学研究科, 助手 (40263066)
Keywords	MHC / ペプチド / ライブラリー / T細胞 / エピトープ / レパートリー
Research Abstract	1)ライブラリーの結合実験値を用いた任意のペプチドに対するMHC結合能の予測 9アミノ酸長のランダムライブラリーを用いてマウスKb、Db、Ldについてポジショナルスキャニングを行った。これらの結合実験値を加算的に扱い、任意のペプチドについてその結合度を予測した。その結果、300〜500アミノ酸長程度の親蛋白質中に存在するペプチドのうち既知のT細胞エピトープのほとんどは上位1〜7番目にランクされ、Ldのように自然エピトープがすべて1位にあげられたものもあった。しかし、MUT1腫瘍ペプチドのように低く予想されたものもあった。このペプチドは実測でも結合能は測定限界以下であった。 2)未知のペプチドに対するMHC結合性の予測上記の予測法を自動化するプログラムを作製した。任意のペプチド約60種について結合能を実測し、予想値と比較した。両者の間には正の相関がみられたが、一桁程度のふれのある分布をみせた。これは、各アミノ酸の貢献が完全に独立には扱いきれないことを反映するものであろう。 4)異なるMHCクラスI分子間でのペプチドレパートリーの比較任意の蛋白質中に存在するペプチドのうち、自然エピトープにみられるような高い結合能が予測されるものについては、MHCの対立遺伝子産物の二つ以上に同時に結合するものはまれであった。 5)Ld+LSPFPFDL,Kb+SIYRYYGLの結晶構造解析同一のT細胞レセプターに認識されるこれら2種のMHC‐ペプチド複合体の構造解析に供するため、Ld,KbのcDNAの細胞外ドメインのみを発現する遺伝子を酵母日導入し、Alcohol Oxidaseのプロモーターの下流の遺伝子座に組み入れを起こしたクローンを得た。

Research Products
(11 results)

All Other

All Publications (11 results)

[Publications] Keiko Udaka: "Decrypting the structure of MHC‐I restricted CTL epitopes with complex peptide libraries." J.Exp.Med.181. 2097‐2108 (1995)
[Publications] Keiko Udaka: "Tolerance to amino acid variations in peptides binding to the MHC class Iproetin H‐2K^b." J.Biol.Chem.270. 24130‐24134 (1995)
[Publications] Keiko Udaka: "Self MHC‐restricted peptides recognized by an alloreactive Tlymphocyte clone." J.Immunol.157. 670‐678 (1996)
[Publications] Udaka,K.: "Decrypting class I MHC‐bound peptides with peptide libraries." TiBS (Trends in Biochemical Sciences). 21. 7‐11 (1996)
[Publications] Udaka,K.: "Decrypting the structure of cytotoxic Tlymphocyte epitopes with complex peptide libraries." in Current Topics of Molecular Evolution. 189‐197 (1996)
[Publications] 宇高恵子: "MHCと抗原ペプチド" Annual Review 免疫1995. 171‐182 (1995)
[Publications] 宇高恵子: "MHC分子によって提示される抗原ペプチドの免疫学的解析" 炎症と免疫. 4(2). 16‐23 (1996)
[Publications] 宇高恵子: "ライブラリーを用いて特異性をさぐる" 生化学. (in press).
[Publications] 宇高恵子: "ライブラリーを用いたT細胞エピトープの解析" 免疫1997‐98. (in press).
[Publications] Keiko Udaka ed. Gunther Jung.: "Random peptide libraries as tools in basic and applied Immunology. in “Peptide Libraries"" VCH Verlag, (1995)
[Publications] 宇高恵子(冨岡玖夫監修): "抗原と抗原提示の分子生物学 in “分子アレルギー学"" メディカルレビュー社 (in press),

1996 Fiscal Year Annual Research Report

ペプチドライブラリーを用いたMHC‐ペプチド複合体の相補的安定化要因の解析

Principal Investigator

宇高 恵子 京都大学, 大学院・理学研究科, 助手 (40263066)

Research Products

[Publications] Keiko Udaka: "Decrypting the structure of MHC‐I restricted CTL epitopes with complex peptide libraries." J.Exp.Med.181. 2097‐2108 (1995)

[Publications] Keiko Udaka: "Tolerance to amino acid variations in peptides binding to the MHC class Iproetin H‐2K^b." J.Biol.Chem.270. 24130‐24134 (1995)

[Publications] Keiko Udaka: "Self MHC‐restricted peptides recognized by an alloreactive Tlymphocyte clone." J.Immunol.157. 670‐678 (1996)

[Publications] Udaka,K.: "Decrypting class I MHC‐bound peptides with peptide libraries." TiBS (Trends in Biochemical Sciences). 21. 7‐11 (1996)

[Publications] Udaka,K.: "Decrypting the structure of cytotoxic Tlymphocyte epitopes with complex peptide libraries." in Current Topics of Molecular Evolution. 189‐197 (1996)

[Publications] 宇高恵子: "MHCと抗原ペプチド" Annual Review 免疫1995. 171‐182 (1995)

[Publications] 宇高恵子: "MHC分子によって提示される抗原ペプチドの免疫学的解析" 炎症と免疫. 4(2). 16‐23 (1996)

[Publications] 宇高恵子: "ライブラリーを用いて特異性をさぐる" 生化学. (in press).

[Publications] 宇高恵子: "ライブラリーを用いたT細胞エピトープの解析" 免疫1997‐98. (in press).

[Publications] Keiko Udaka ed. Gunther Jung.: "Random peptide libraries as tools in basic and applied Immunology. in “Peptide Libraries"" VCH Verlag, (1995)

[Publications] 宇高恵子(冨岡玖夫 監修): "抗原と抗原提示の分子生物学 in “分子アレルギー学"" メディカルレビュー社 (in press),

宇高恵子京都大学, 大学院・理学研究科, 助手 (40263066)

[Publications] 宇高恵子(冨岡玖夫監修): "抗原と抗原提示の分子生物学 in “分子アレルギー学"" メディカルレビュー社 (in press),