1997 Fiscal Year Annual Research Report

先天性心臓奇形症候群の原因遺伝子のクローニング

Research Project

Project/Area Number	08457231
Research Institution	Keio University
Principal Investigator	蓑島伸生慶應義塾大学, 医学部, 講師 (90181966)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	清水信義慶應義塾大学, 医学部, 教授 (50162706)
Keywords	先天性心奇形症候群 / 猫目症候群 / マーカー染色体 / 領域特異的コスミドライブラリー / BACライブラリー / BAC / コスミドコンティグ / ゲノミックシーケンシング / 遺伝子予測
Research Abstract	猫眼症候群(CES)における心臓奇形発生の原因遺伝子追究のために以下の研究を遂行した。 (1)CES染色体領域(CER:1.9Mb)のBAC/コスミドコンティグの構築を進めた。材料には、ともに当研究室で独自に作製した猫眼症候群マーカー染色体特異的コスミドライブラリー(9,200クローン、重複度:10)とヒト全ゲノムBACライブラリー(20万クローン、重複度:7.5)を用いた。現在、BAC33クローンとコスミド43クローンで1.3Mbのゲノム領域をカバーしている。CERはセントロメア近傍であるため反復配列の種類も数も多く、コンティグ構築、シーケンシング(次項)は他の領域よりも困難であるが、CER特異的コスミドライブラリーを用いているために進捗している。 (2)構築しているコンティグの中からBAC3クローンとコスミド5クローンのゲノムシーケンシングをほぼ終了した。それらはCER中の300kbの領域をカバーしている。 (3)得られたゲノムシーケンスをコンピュータ解析(BLASTによる相同性検索とXGRAILなどを用いたエキソン予測)して遺伝子の予測とcDNA分離を進めた。その結果、KB67B5の配列からt-コンプレックス1θサブユニットにアミノ酸レベルで56%の相同性を示すイントロンレスの新規遺伝子を発見した。また、KB556G11からはESTデータベースに登録のあるcDNAに100%のホモロジーを示すエキソンを2個発見した。現在、ともに全長cDNAの分離を試みている。 (4)カナダのH.McDermidとの共同研究でエキソン・トラッピングによる遺伝子同定を進めた。その結果KB70A6クローンからマウスBid2の相同遺伝子をクローニングした。Bid2はアポトーシスの制御への関与が報告されており、初期発生の過程である種の細胞系譜の出現、消失を制御している可能性も考えられる。

Research Products

(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] Kawasaki,K.: "One megabase sequence analysis of the human immunoglobulin λ gene locus" Genome Research. 7(3). 250-261 (1997)
[Publications] Nagamine,K.: "Genomic Organization and complete nucleotide,sequence of the human PWP2 gene on chromosome21" Genomics. 42(3). 528-531 (1997)
[Publications] Chrast,R.: "Cloning of two human homologs of the Drosophila single-minded gene SIM1 on chromosome 6q and SIM2 on 21q within the Down syndrome chromosomal region" Genome Research. 7(6). 615-624 (1997)
[Publications] Asakawa,S.: "Human BAC library : construction and rapid screening" Gene. 191(1). 69-79 (1997)
[Publications] Nagamine,K.: "Positional cloning of the APECED gene" Nature Genetics. 17(4). 393-398 (1997)
[Publications] Kubota,R: "Genomic organization of the human myocilin gene (MYOC) responsible for primary open angle glaucoma (GLCIA)" Biochemical and Biophysical Research Communications. 242(2). 396-400 (1998)
[Publications] Minoshima,S.: "Proceedings Genome Informatics Workshop 1997" Universal Academy Press,Inc.,Tokyo, 2 (1997)

1997 Fiscal Year Annual Research Report

先天性心臓奇形症候群の原因遺伝子のクローニング

Principal Investigator

蓑島 伸生 慶應義塾大学, 医学部, 講師 (90181966)

Research Products

[Publications] Kawasaki,K.: "One megabase sequence analysis of the human immunoglobulin λ gene locus" Genome Research. 7(3). 250-261 (1997)

[Publications] Nagamine,K.: "Genomic Organization and complete nucleotide,sequence of the human PWP2 gene on chromosome21" Genomics. 42(3). 528-531 (1997)

[Publications] Chrast,R.: "Cloning of two human homologs of the Drosophila single-minded gene SIM1 on chromosome 6q and SIM2 on 21q within the Down syndrome chromosomal region" Genome Research. 7(6). 615-624 (1997)

[Publications] Asakawa,S.: "Human BAC library : construction and rapid screening" Gene. 191(1). 69-79 (1997)

[Publications] Nagamine,K.: "Positional cloning of the APECED gene" Nature Genetics. 17(4). 393-398 (1997)

[Publications] Kubota,R: "Genomic organization of the human myocilin gene (MYOC) responsible for primary open angle glaucoma (GLCIA)" Biochemical and Biophysical Research Communications. 242(2). 396-400 (1998)

[Publications] Minoshima,S.: "Proceedings Genome Informatics Workshop 1997" Universal Academy Press,Inc.,Tokyo, 2 (1997)

蓑島伸生慶應義塾大学, 医学部, 講師 (90181966)