1997 Fiscal Year Annual Research Report

特異的DNA構造から解析するヒト・グロビン遺伝子スイッチング制御

Research Project

Project/Area Number	08680749
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Research Institution	Nippon Medical School
Principal Investigator	木山裕子日本医科大学, 医学部, 講師 (60234390)
Keywords	ヒト・グロビン遺伝子 / 特異的DNA構造 / bent DNA / ヌクレオソーム位相 / 転写制御
Research Abstract	本研究は、ヒト・グロビン遺伝子の発現スイッチング機構を遺伝子構造から捉え解明する目的で、β-グロビン遺伝子全座にわたり特異的DNA構造(bent DNA構造及び三重鎖DNA構造)を同定し、それらの特異的構造が発生段階特異的遺伝子発現にどのような関連性を持つのかシス及びトランス両面の制御をふまえて検討する事を主眼としている。本年度行った研究を概要すると、全長約65kbにわたるβ-郡座全領域のDNA折れ曲がり部位のマップを完成しえた。マッピングの結果、合計97箇所の折れ曲がり部位が同定され、平均678bpの周期性を持って存在していた。この周期性は、転写制御に重要なLCR(Locus Control Region)のDNase I hypersensitive siteや重複遺伝子の連結部位など、発現上あるいは進化上重要かつ興味ある領域で周期性が乱れている事から、折れ曲がり部位の周期性は様々な環境下でのクロマチン構造を規定する一因子として働いていることが示唆された。さらに、周期性bent DNA構造という観点からβ-グロビン遺伝子座のDNA複製開始領域(ori)のクロマチン構造、特にヌクレオソーム構造について解析をおこなった。その結果、折れ曲がり部位の周期性はこの領域で乱れており、ori部位はちようど2つの折れ曲がり部位の中間に位置しori部位と重ならないようにずれている事が解った。また、ヌクレオソーム位相は、折れ曲がり部位にコア部分が、S1ヌクレアーゼ感受性を示すマイクロサテライト配列にリンカー部分が位置しており、ori配列と考えられているA+Tリッチ配列はコア部分に相当していた。これは、LCR領域のエンハンサー部位と類似の位置関係であり、DNA複製開始領域においても周期性bentDNAが特異的なクロマチン構造を規定しているものと考えられた。

Research Products
(6 results)

All Other

All Publications (6 results)

[Publications] 木山裕子: "Chromatin organization at the human β-globin reprication origin based on periodic bent DNA" Blood(Abstract). 90. 276a (1997)
[Publications] 木山裕子: "An intrachromosonal repeating unit based on DNA bending." Mol:cell.Biol.16・10. 5664-5673 (1996)
[Publications] 木山裕子: "Conservation and periodicity of DNA bend sites in eukaryotic genomes." DNA Res.3. 25-30 (1996)
[Publications] 木山裕子: "A structural basis for DNase I-hypersensitive sites in the human β-globin locus control region" Blood(Abstract). 88. 148a (1996)
[Publications] 木山裕子: "Conservation and periodicity of DNA bend sites in the human β-globin gene locus." J.Biol.Chem.270・21. 12439-12445 (1995)
[Publications] 木山裕子: "Periodicity of DNA bent sites in the human ε-globin gene region: Possibility of sequence-directed nucleosome phasing." J.Biol.Chem.269・35. 22238-22244 (1994)

1997 Fiscal Year Annual Research Report

特異的DNA構造から解析するヒト・グロビン遺伝子スイッチング制御

Principal Investigator

木山 裕子 日本医科大学, 医学部, 講師 (60234390)

Research Products

[Publications] 木山 裕子: "Chromatin organization at the human β-globin reprication origin based on periodic bent DNA" Blood(Abstract). 90. 276a (1997)

[Publications] 木山 裕子: "An intrachromosonal repeating unit based on DNA bending." Mol:cell.Biol.16・10. 5664-5673 (1996)

[Publications] 木山 裕子: "Conservation and periodicity of DNA bend sites in eukaryotic genomes." DNA Res.3. 25-30 (1996)

[Publications] 木山 裕子: "A structural basis for DNase I-hypersensitive sites in the human β-globin locus control region" Blood(Abstract). 88. 148a (1996)

[Publications] 木山 裕子: "Conservation and periodicity of DNA bend sites in the human β-globin gene locus." J.Biol.Chem.270・21. 12439-12445 (1995)

[Publications] 木山 裕子: "Periodicity of DNA bent sites in the human ε-globin gene region: Possibility of sequence-directed nucleosome phasing." J.Biol.Chem.269・35. 22238-22244 (1994)

木山裕子日本医科大学, 医学部, 講師 (60234390)

[Publications] 木山裕子: "Chromatin organization at the human β-globin reprication origin based on periodic bent DNA" Blood(Abstract). 90. 276a (1997)

[Publications] 木山裕子: "An intrachromosonal repeating unit based on DNA bending." Mol:cell.Biol.16・10. 5664-5673 (1996)

[Publications] 木山裕子: "Conservation and periodicity of DNA bend sites in eukaryotic genomes." DNA Res.3. 25-30 (1996)

[Publications] 木山裕子: "A structural basis for DNase I-hypersensitive sites in the human β-globin locus control region" Blood(Abstract). 88. 148a (1996)

[Publications] 木山裕子: "Conservation and periodicity of DNA bend sites in the human β-globin gene locus." J.Biol.Chem.270・21. 12439-12445 (1995)

[Publications] 木山裕子: "Periodicity of DNA bent sites in the human ε-globin gene region: Possibility of sequence-directed nucleosome phasing." J.Biol.Chem.269・35. 22238-22244 (1994)