1997 Fiscal Year Annual Research Report

ヒトMHC領域と相同性をしめす第9染色体領域のゲノム解析によるMHC進化の解明

Research Project

Project/Area Number	09044337
Research Institution	Tokai University
Principal Investigator	猪子英俊東海大学, 医学部, 教授 (10101932)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	TILANUS Marc University Hospital Utrecht Department o, 教授 BECK Stephan Imperial Cancer Research Fund DNA Sequen, 主任研究員 TROWSDALE Jo University of Cambridge Department of Im, 教授安藤麻子東海大学, 医学部, 講師 (40101935)
Keywords	HLA領域 / 第9染色体9q33-44領域 / 相同遺伝子 / 第1染色体1q21-25領域 / 進化 / ゲノム構造
Research Abstract	ヒトの第6染色体6p21.3領域に位置するHLA領域と相同性を有する遺伝子が多数みいだされるヒト第9染色体9q33-34領域、第1染色体1q21-25領域のゲノム構造をHLA領域と比較、解析することにより、MHCの進化の起源と進化の過程を解明することを目的として、まずHLA領域のなかで塩基配列が未決定のHLAクラスI領域の1.3Mbについて、ショットガン法により大量シークエンシングを行い、新遺伝子の同定を試みた。その結果、この領域に16個の既知遺伝子、23個の新発現遺伝子、6個の新偽遺伝子の合計45個の遺伝子が同定され、現在これら新遺伝子の機能を解析している。代9染色体9q33-34領域と第1染色体1q22-23については、相同遺伝子の配列順序を明らかにするためにこれらの領域を含むと考えられるYACクローンを用いて、この領域に座位する遺伝子とSTSマーカーのPCR解析を行った。その結果、9q33-34領域については、セントロメア側からHXB-C5-GRP78の順序に各遺伝子が位置することが明らかになった。1q22-23領域については、非古典的MHC遺伝子として知られているCD1遺伝子を含む1.4Mbの領域のYACとPACコンティグを作成した。PACクローンの末端シークエンスとPCR解析からこのコンティグには、セントロメア側からCD1D-CD1A-CD1C-CD1B-CD1E-SPTA1-FY-IFI-16-FCERIAの順序に9遺伝子が位置することが明らかになった。さらにこのコンティグは、PACクローンを用いたFiber-FISH法によっても確認された。また、FCERIA遺伝子のテロメア側の領域を含むと考えられるYACクローンを用いたPCR解析から、セントロメア側からFCERIA-PBX1-ALDH9-RXRG-POU2F1-CD3Z-ATAC-FV-FMO1-FASLの順序で遺伝子が位置していた。以上の解析から、1q22-23領域にはSPTA1,FY,IFI-16,FCERIA,CD3Zのような免疫反応に重要な遺伝子が数多く位置することが明らかになった。

Research Products
(8 results)

All Other

All Publications (8 results)

[Publications] Mizuki N.et al.: "Triplet repeat polymorphism in the transmembrane region of the MICA gene : A strong association of six GCT repetitions with Behcets disease." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 94. 1298-1303 (1997)
[Publications] Sugaya K.et al.: "Gene organization of human NOTCH4 and(CTG)n polymorphism in this human counterpart gene of mouse proto- oncogene int-3." Gene. 244. 189-235 (1997)
[Publications] Mizuki N.et al.: "Nucleotide sequencing analysis of the HLA class I region spanning the 237kb segment around the HLA-B and C genes." Genomics. 42. 55-66 (1997)
[Publications] Kikuti Y.Y.et al.: "Physical mapping 220 kb centromeric of the human MHC and DNA sequence anlysis of the 43-kb segment including the RING1,HKE6,and HKE4 genes." Genomics. 42. 422-435 (1997)
[Publications] Tenzen T.et al.: "Precise switching of DNA replication timing in the GC content transition area in the human major histocompatibility complex." Mol.Cell.Biol.17. 4043-4050 (1997)
[Publications] Pellet P.et al.: "Allelic repertoire of the human MICB gene." Immunogenetics. 46. 434-436 (1997)
[Publications] 高田肇、猪子英俊: "ネオ生物学シリーズ第9巻ゲノムからみた新しい生物像-「ヒト」遺伝子が語るヒトのすがた" 共立出版, 83-100 (1997)
[Publications] 安藤麻子他: "蛋白質核酸酵素別冊ゲノムサイエンス" 共立出版, 2704-2713 (1997)

1997 Fiscal Year Annual Research Report

ヒトMHC領域と相同性をしめす第9染色体領域のゲノム解析によるMHC進化の解明

Principal Investigator

猪子 英俊 東海大学, 医学部, 教授 (10101932)

Research Products

[Publications] Mizuki N.et al.: "Triplet repeat polymorphism in the transmembrane region of the MICA gene : A strong association of six GCT repetitions with Behcets disease." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 94. 1298-1303 (1997)

[Publications] Sugaya K.et al.: "Gene organization of human NOTCH4 and(CTG)n polymorphism in this human counterpart gene of mouse proto- oncogene int-3." Gene. 244. 189-235 (1997)

[Publications] Mizuki N.et al.: "Nucleotide sequencing analysis of the HLA class I region spanning the 237kb segment around the HLA-B and C genes." Genomics. 42. 55-66 (1997)

[Publications] Kikuti Y.Y.et al.: "Physical mapping 220 kb centromeric of the human MHC and DNA sequence anlysis of the 43-kb segment including the RING1,HKE6,and HKE4 genes." Genomics. 42. 422-435 (1997)

[Publications] Tenzen T.et al.: "Precise switching of DNA replication timing in the GC content transition area in the human major histocompatibility complex." Mol.Cell.Biol.17. 4043-4050 (1997)

[Publications] Pellet P.et al.: "Allelic repertoire of the human MICB gene." Immunogenetics. 46. 434-436 (1997)

[Publications] 高田 肇、猪子 英俊: "ネオ生物学シリーズ第9巻 ゲノムからみた新しい生物像-「ヒト」遺伝子が語るヒトのすがた" 共立出版, 83-100 (1997)

[Publications] 安藤 麻子 他: "蛋白質核酸酵素別冊 ゲノムサイエンス" 共立出版, 2704-2713 (1997)

猪子英俊東海大学, 医学部, 教授 (10101932)

[Publications] 高田肇、猪子英俊: "ネオ生物学シリーズ第9巻ゲノムからみた新しい生物像-「ヒト」遺伝子が語るヒトのすがた" 共立出版, 83-100 (1997)

[Publications] 安藤麻子他: "蛋白質核酸酵素別冊ゲノムサイエンス" 共立出版, 2704-2713 (1997)