1999 Fiscal Year Annual Research Report

RNAエディティングの検証と植物分子系統樹の再構築

Research Project

Project/Area Number	09304076
Research Institution	Shizuoka University
Principal Investigator	吉永光一静岡大学, 理学部, 教授 (70021954)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	伊藤元己千葉大学, 理学部, 助教授 (00193524) 植田恭司金沢大学, 理学部, 教授 (60184925) 山田恭司富山大学, 理学部, 教授 (70200714) 長谷部光泰岡崎国立共同研究機構, 基礎生物学研究所, 助教授 (40237996) 門脇光一農林水産省, 農業生物資源研究所, 農林水産技官
Keywords	RNAエディティング / 葉緑体 / ミトコンドリア / コケ植物 / ツノゴケ類 / タイ類 / シダ植物 / 小葉類
Research Abstract	1,コケ植物ツノゴケ類のホウライツノゴケにおけるRNAエディティング葉緑体では、20種以上の遺伝子の転写物がエディティングを受けていた。これらの特徴は、1,000塩基あたり20〜4のエディティング部位があり、全てのエディティングが指定するアミノ酸を換える。また、CからUへの変換とUからCへの変換がほぼ同数みつかり、全ての変換は同じRNA上にあるガイドRNA(gRNA)によって指定される。ミトコンドリアのcoxl転写物では420塩基あたり13箇所のエディティングがあり、その内UからCへの変換が4箇所有った。 2,コケ植物タイ類のRNAエディティング 4種のタイ類のミトコンドリアを調べたが、エディティングを検出できなかった。 3,小葉類の葉緑体におけるRNAエディティング 4種の小葉類では多くの部位でのエディティングがあり、UからCへの変換もあった。また、gRNAに相当する配列も同じRNA上にみつかった。 4,シダ植物におけるRNAエディティングワラビとマツバランの葉緑体を分析した結果、ワラビの14遺伝子の転写物で約90箇所のエディティングがあり、その内にはUからCへの変換もみつかった。しかし、マツバランでは葉緑体ゲノム全ての転写物について、エディティングの可能性を調べたが、エディティングを検出することはできなかった。ヒカゲノカズラのミトコンドリアでは、420塩基あたり5箇所のエディティングがあり、全てCからUへの変換であった。以上のことから、RNAエディティングの有無は植物進化についての情報を提供できないであろうと結論した。また、遺伝子構造に基づく分子系統樹が示す植物の相対的位置はエディティングを考慮しても変化しなかった。

Research Products

(6 results)

All Other

All Publications (6 results)

[Publications] Fujii,N.: "Further analysis of intraspecific sequence variation of chloroplast DNA in Primula cuneifolia Ledeb.(Primulaceae) : Implications for"J.Plant Res.. 112. 87-95 (1999)
[Publications] Senjo,M.: "Extensive mitochondrial introgression from Pinus pumila to P.parviflora var.pentaphylla(Pinaceae)"J.Plant Ras.. 112. 97-105 (1999)
[Publications] Sindo,S.: "Characterization of MADS genes in the gymnosperm Gnetum parvifolium and its implication on the evolution of reproductive organs"Evolution and Development. 1. 180-190 (1999)
[Publications] WolfP.G.,: "Phylogenetic relationships of the enigmatic families Hymenophyllopsidaceae and Lophosoriaceae : evidence from rbcL"Plant Syst.Evol.. 219. 263-270 (1999)
[Publications] Kato,S,.: "Analysis of mitochondrial DNA of an cndangcrcd bccch spccics,Fagus hayatae Palibinex Hayata"New Forest. 19. 109-114 (2000)
[Publications] Kudo,N.: "A single nuclear transcript encoding mitochondrial RPS14 and SDHB of rice is processed by alternative splicing : Common use of the same"Proc.Natl.Acad.Sci.USA.. 96. 9207-9211 (1999)

1999 Fiscal Year Annual Research Report

RNAエディティングの検証と植物分子系統樹の再構築

Principal Investigator

吉永 光一 静岡大学, 理学部, 教授 (70021954)

Research Products

[Publications] Fujii,N.: "Further analysis of intraspecific sequence variation of chloroplast DNA in Primula cuneifolia Ledeb.(Primulaceae) : Implications for"J.Plant Res.. 112. 87-95 (1999)

[Publications] Senjo,M.: "Extensive mitochondrial introgression from Pinus pumila to P.parviflora var.pentaphylla(Pinaceae)"J.Plant Ras.. 112. 97-105 (1999)

[Publications] Sindo,S.: "Characterization of MADS genes in the gymnosperm Gnetum parvifolium and its implication on the evolution of reproductive organs"Evolution and Development. 1. 180-190 (1999)

[Publications] WolfP.G.,: "Phylogenetic relationships of the enigmatic families Hymenophyllopsidaceae and Lophosoriaceae : evidence from rbcL"Plant Syst.Evol.. 219. 263-270 (1999)

[Publications] Kato,S,.: "Analysis of mitochondrial DNA of an cndangcrcd bccch spccics,Fagus hayatae Palibinex Hayata"New Forest. 19. 109-114 (2000)

[Publications] Kudo,N.: "A single nuclear transcript encoding mitochondrial RPS14 and SDHB of rice is processed by alternative splicing : Common use of the same"Proc.Natl.Acad.Sci.USA.. 96. 9207-9211 (1999)

吉永光一静岡大学, 理学部, 教授 (70021954)