分子複合体のX線解析による蛋白質の分子認識機構の研究

1999 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 09308025
• Research Institution: Nara Institute of Science and Technology
• Principal Investigator: 箱嶋 敏雄 奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (00164773)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 清水 敏之 奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 助手 (30273858)
• Keywords: 蛋白質 / DNA / 分子認識 / 構造生物学 / X線

Research Abstract

本年度は、主に、分裂酵母由来のbZIP型転写因子Pap1のDNA結合ドメインとDNAオリゴマーとの複合体結晶の高分解能(2.0Å)の構造決定を行った。bZIP型転写因子は真核細胞において最も大きいファミリーの一つを形成しており、AP-1(TGACTCA)やATF/CREB(TGACGTCA)配列と異なる塩基配列を認識する幾つかのサブファミリーが存在することが知られるようになったが、それらの認識機構は不明であった。構造決定したPap1もその例であり、認識配列はTTACGTAAである。今回の複合体構造では、通常のbZIP型転写因子は塩基配列を認識する塩基性領域において、NxxAAxxCR配列を持つが、Pap1はNxxAQxxFRとなっており、置換しているグルタミンとフェニルアラニンがTT配列の認識に直接関与することがわかったが、興味深いことに、保存されている重要な残基の一つであるアスパラギンは本来、TG配列を認識しているが、本構造では側鎖のコンホメーションを変化させて、TT配列を認識していた。また、低分子量Gタンパク質RhoAとその標的タンパク質キナーゼPKNの結合ドメインの複合体結晶の構造の論文を出版した。

Research Products

• [Publications] R.Maesaki: "The structural basis of Rho effector"Molecular Cell. 4. 793-803 (1999)
• [Publications] R.Maesaki: "Biochemical and crystallographic characterizatim"J.Struct.Biol.. 126. 166-170 (1999)
• [Publications] Y.Fujii: "Crgstal stvucture of au IRF/DNA complex"EMBO J.. 18. 5028-5041 (1999)
• [Publications] S.Hirotsu: "Crystal structure of a stress-iuduclol"Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 96. 12333-12338 (1999)
• [Publications] S.Hirotsu: "Crystallographie Characterization"J.Struct.Biol.. 126. 80-83 (1999)
• [Publications] K.Tomita: "The crsstal structure of a lef-handed"Ncleosides & Nucleotides. 18. 1567-1569 (1999)