1997 Fiscal Year Annual Research Report

イネ人工染色体の構築と導入植物の作出-人工染色体の育種工学への利用の基盤

Research Project

Project/Area Number	09460006
Research Institution	National Institute of Genetics
Principal Investigator	倉田のり国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 助教授 (90178088)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	野々村賢一国立遺伝学研究所, 実験圃場, 助手 (10291890)
Keywords	イネ / イネ人工染色体(RAC) / 酵母人工染色体(YAC) / セントロメア / テロメア / 人工染色体導入植物 / 育種工学
Research Abstract	本年度は、研究実施計画項目として上げた中で、人工染色体の構築に不可欠であるイネ動原体領域DNAの単離と構造解析を行った。(1)まず、動原体領域に位置する反復配列をクローニングするため、穀類ゲノムの動原体部に共通と考えられる配列をプライマーとして、イネゲノムより250bpの反復単位をPCR断片としてクローニングした。(2)この配列でゲノムに対しサザンハイブリダイゼーションを行い、反復配列の構成要素であることが確認できたので、このDNAをプローブとしてファージのゲノムライブラリーをスクリーニングし、この配列が複数個含まれると考えられる14kbのゲノムクローンを単離した。(3)14kbの塩基配列を決定した結果、1.9kbのdirect repeatが数キロの介在配列を挟んで3個並んだ構造であった。1.9kbのdirect repeatはホモロジーの高さによって3つの領域に分かれ、3個の間で相互に非常に相同性の高い部分(95%以上)から、少し低い部分まで(70%程度)が存在していた。さらに高度類似領域には、哺乳類CENP-B box様配列が見られ、介在配列領域にも2-3種類の他の反復配列が存在していた。またこの14kbの中にはMAR(Matrix Attachment Region)やCEN領域に特徴的にみられるようなpalindrom、A/T rich領域等が見られ、CENの候補断片である可能性が強く示唆された。(4)1.9kbのdirect repeatをプローブとして、染色体上でのFISHを行ったところ、殆どの染色体の動原体あるいは動原体ヘテロクロマチン領域に局在してシグナルが出現した。これらのことより、我々の得たDNAは、動原体の構成要素である可能性が極めて高く、さらにこの14kb DNAを含むより大きな動原体部を得て、細胞に導入することによりその機能解析を進める予定である。

Research Products

(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] H.Tanoue: "Ordered YAC clone contigs assigned to rice chromosomes 3 and 11." DNA Research. 4. 133-140 (1997)
[Publications] N.Kurata: "Physical mapping of the rice genome with yeast artifical chromosome clones." Plant Molecular Biology. 35. 101-113 (1997)
[Publications] T.Foote: "Detailed comparative mapping of cereal chromosome regions corresponding to the Ph1 locus in wheat." Genetics. 147. 801-807 (1997)
[Publications] M.Yano: "Identification of quantitative trait loci conferring heading date of rice using a highdensity linkage map." Theoretical and Applied Genetics. 95. 1025-1032 (1997)
[Publications] Y.Harushima: "A high density rice genetic linkage map with 2275 markers using a single F2 population." Genetics. 148. 479-494 (1998)
[Publications] S.Yoshimura: "Expression of Xa-1,a novel bacterial blight resistance gene in rice,is induced by bacterial inoculation." Proc.Natl.Acad.Sci.USA.95. 1663-1668 (1998)
[Publications] N.Kurata: "DNA markers:Protocols,Applications and Overviews." John Wiley and Sons,Inc.NY, 364 (1997)

1997 Fiscal Year Annual Research Report

イネ人工染色体の構築と導入植物の作出-人工染色体の育種工学への利用の基盤

Principal Investigator

倉田 のり 国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 助教授 (90178088)

Research Products

[Publications] H.Tanoue: "Ordered YAC clone contigs assigned to rice chromosomes 3 and 11." DNA Research. 4. 133-140 (1997)

[Publications] N.Kurata: "Physical mapping of the rice genome with yeast artifical chromosome clones." Plant Molecular Biology. 35. 101-113 (1997)

[Publications] T.Foote: "Detailed comparative mapping of cereal chromosome regions corresponding to the Ph1 locus in wheat." Genetics. 147. 801-807 (1997)

[Publications] M.Yano: "Identification of quantitative trait loci conferring heading date of rice using a highdensity linkage map." Theoretical and Applied Genetics. 95. 1025-1032 (1997)

[Publications] Y.Harushima: "A high density rice genetic linkage map with 2275 markers using a single F2 population." Genetics. 148. 479-494 (1998)

[Publications] S.Yoshimura: "Expression of Xa-1,a novel bacterial blight resistance gene in rice,is induced by bacterial inoculation." Proc.Natl.Acad.Sci.USA.95. 1663-1668 (1998)

[Publications] N.Kurata: "DNA markers:Protocols,Applications and Overviews." John Wiley and Sons,Inc.NY, 364 (1997)

倉田のり国立遺伝学研究所, 系統生物研究センター, 助教授 (90178088)