1998 Fiscal Year Annual Research Report

H^+-ATP合成酵素の溶液および固体多次元NMRによる構造・機能解析

Research Project

Project/Area Number	09480173
Research Institution	Yokohama National University
Principal Investigator	阿久津秀雄横浜国立大学, 工学部, 教授 (60029965)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	小澤潔横浜国立大学, 工学部, 助手 (20251770) 藤原敏道横浜国立大学, 工学部, 助教授 (20242381)
Keywords	H^+-ATP合成酵素 / F_1-ATPase / NMR / 固体NMR / H^+-ATP合成酵素βサブユニット / H^+-ATP合成酵素cサブユニット / 化学合成
Research Abstract	好熱性細菌由来のH^+-ATP合成酵素のTF_1ドメインのβサブユニット中に12個存在し、一次配列上比較的均等に分布しているTyr残基の芳香環の^1H-NMRシグナルのうちまだ帰属の明確でなかったシグナルについて2重の点突然変異を導入することにより帰属を行った。その結果、一つのアミノ酸残基が2本のシグナルを与えるものが最低3つあることが明らかになった。さらに、ヌクレオチドはこの二つの構造の一方にしか結合しないことも明らかになった。この際、試料調製に本研究で購入した振とう機およびインキュベートボックスを用いた。また、固体NMRでβサブユニット中のATPの構造解析を行うために、試料調製法をさらに検討したところ、トレハロース存在下で急速凍結法・再水和を行うとATP-TF_1βサブユニット複合体の^<31>P-NMRシグナルがさらにシャープになった。したがって、これは複合体構造を安定化させるものと考えられる。一方、Foの構成成分であるサブユニットcについては、再構成を考えて大腸菌の系を使うこととし、安定同位体ラベルされたアミノ酸を任意に組み込むことができるような化学的合成が可能であるとの目途をつけた。固体3次元異方性相関NMRを用いてC-13、N-15でフルラベルしたアミノ酸残基の側鎖の二面角を決定する方法論を開発した。これはα位とβ位のC-Hの双極子相互作用の相関を利用するもので、前者の双極子相互作用で展開した後にその^<13>Cの磁化をβ位の^<13>Cに移し、再びプロトンと双極子相互作用で展開する。この両者の相関スペクトルをさまざまな二面角のシミュレーションスペクトルと比較する。この際、^<13>Cα-^<13>Cβ間の磁化移動が非等法的になることを利用して高い精度で二面角お決定できる。二面角にととまらず、結合角、結合長も同時に決定できることが明らかになった。

Research Products

(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] S.Kim: "The Interactions of ferric and ferrous cytochrome c with cardiolipin in phospholipid membranes studied by solid-state ^2H and ^<31>P NMR." J.Mol.Struct.441. 183-188 (1998)
[Publications] T.Odahara: "Membrane dynamics in the intact PM2 phage and its host cells as monitored by T_1ρ(H)." Biochim.Biophys.Acta.1369. 240-246 (1998)
[Publications] T.Ishida: "A primitive pathway of porphyrin biosynthesis and enzymology in Desulfovibrio vulgaris." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 95. 4853-4858 (1998)
[Publications] T.Ohmura: "Paramagnetic Inversion of the sign of the interference contribution to the transverse relaxation of the imido protons of the coordinated imidazoles in the uniformly ^<15>N labeled cytochrome c_3" J.Magn.Reson.131. 367-372 (1998)
[Publications] T.Fujiwara: "Multidimensional solid-state NMR for determining dihedral angle from the correlation of ^<13>C-^1H and ^<13>C-^<13>C dipolar interactions under magic-angle spinning conditions." J.Chem.Phys.109. 2380-2393 (1998)
[Publications] T.Ohmura: "Ionic-strength dependent physicochemical factors in cytochrome c_3 regulating the electron transfer rate." Biophys.J.75. 1483-1490 (1998)
[Publications] 阿久津秀雄: "構造生物学とその解析法(分担)" 共立出版, 14 (1997)

1998 Fiscal Year Annual Research Report

H^+-ATP合成酵素の溶液および固体多次元NMRによる構造・機能解析

Principal Investigator

阿久津 秀雄 横浜国立大学, 工学部, 教授 (60029965)

Research Products

[Publications] S.Kim: "The Interactions of ferric and ferrous cytochrome c with cardiolipin in phospholipid membranes studied by solid-state ^2H and ^<31>P NMR." J.Mol.Struct.441. 183-188 (1998)

[Publications] T.Odahara: "Membrane dynamics in the intact PM2 phage and its host cells as monitored by T_1ρ(H)." Biochim.Biophys.Acta.1369. 240-246 (1998)

[Publications] T.Ishida: "A primitive pathway of porphyrin biosynthesis and enzymology in Desulfovibrio vulgaris." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 95. 4853-4858 (1998)

[Publications] T.Ohmura: "Paramagnetic Inversion of the sign of the interference contribution to the transverse relaxation of the imido protons of the coordinated imidazoles in the uniformly ^<15>N labeled cytochrome c_3" J.Magn.Reson.131. 367-372 (1998)

[Publications] T.Fujiwara: "Multidimensional solid-state NMR for determining dihedral angle from the correlation of ^<13>C-^1H and ^<13>C-^<13>C dipolar interactions under magic-angle spinning conditions." J.Chem.Phys.109. 2380-2393 (1998)

[Publications] T.Ohmura: "Ionic-strength dependent physicochemical factors in cytochrome c_3 regulating the electron transfer rate." Biophys.J.75. 1483-1490 (1998)

[Publications] 阿久津秀雄: "構造生物学とその解析法(分担)" 共立出版, 14 (1997)

阿久津秀雄横浜国立大学, 工学部, 教授 (60029965)