タンパク質の動的構造研究のためのX線溶液散乱解析システムの開発

1999 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 09558093
• Research Institution: Yokohama City University
• Principal Investigator: 佐藤 衛 横浜市立大学, 大学院・総合理学研究科, 教授 (60170784)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 雨宮 慶幸 東京大学, 工学部, 教授 (70151131) ; 片岡 幹雄 奈良先端科学技術大学院大学, 物質創成科学研究科, 教授 (30150254)
• Keywords: X線溶液散乱 / X線小角散乱 / 時分割測定 / 動的構造解析 / タンパク質の溶液構造

Research Abstract

佐藤は、これまで使用してきた湾曲全反射ミラーによる入射X線を集光させるX線光学系に代わり、入射X線を「人工多層膜集光ミラー」で集光させる光学系をX線溶液散乱解析システムに組み込んだ。その結果、試料溶液に照射するX線強度を従来の光学系に比べて10倍以上向上させるとともに、入射X線の集光度も格段に向上させることに成功した。
また、片岡は、時分割測定の可能性を拡張するため、紫膜の光反応の時間分解X線散乱データに対して、特異値分解法を適用することにより、光吸収後に生成するシッフ塩基の脱プロトン化した中間体(M中間体)からの戻り反応において、2つの異なる構造を取ることを明らかにした。その結果、速い成分はMに、遅い成分はN中間体の特徴を示し、先に提唱したプロトンポンプの分子機構モデルの妥当性を支持する結果を得た。
一方、雨宮は、X線イメージインテンシファイヤーと冷却CCDを組み合わせた高感度2次元X線検出器を開発し、イメージングプレートまたは一次元位置敏感型ガス検出器と比較した。その結果、X線イメージインテンシファイヤー由来のコントラストの低下があることが判明したが、この問題を解決する方法を考案し、X線溶液散乱では、コントラストの低下の問題が完全に補正できることを示した。昨年度に行った補正ソフトの開発を併せて、本システムがX線溶液散乱実験において、高感度で時間分割測定に最適な検出器システムであることを明らかにした。さらに、蛍光体と縮小型光ファイバーをCCDに組み合わせたモジュールをモザイク状に並べたアレイ状CCD型X線検出器を製作し、3×6個のCCDをアレイ状に並べた有効面積236×236mmのCCD型X線検出器を製作した。

Research Products

• [Publications] 佐藤 衛: "3D-1D法によるタンパク質の立体構造予測とX線溶液散乱"生物物理. (印刷中). (2000)
• [Publications] 佐藤 衛: "中性子溶液散乱でみる巨大ウイルス粒子の内部構造"研究炉のひろば. 11巻. 6-6 (1999)
• [Publications] Y.Odagaki: "The Cryatal Structure of Pyroglutamyl Peptidase I from Bacillus Amyliloquefaciens Reveals a New Structure for a Cysteine Protease"Structure. 7巻. 399-411 (1999)
• [Publications] M.Tomita: "Two Concentric Protein Shell Structure with Spikes of Silkworm Bombyx mori Cytoplasmic Polyhedrosis Virus Revealed by Small-angle Neutron Scattering Using the Contrast Variation Method"J.Biochem.. 125巻. 916-922 (1999)
• [Publications] H.Soto: "Pressure and Temperature Effects on a Phase Transition from a Dense Droplet to a Lamellar Structure in a Ternary Miscoemulsion"J.Chem.Phys.. (印刷中). (2000)
• [Publications] Y.Hasegawa: "Tunable X-ray Polarization Reflector with Perfect Crystals"Acta Cryst.. A55巻. 955-962 (1999)
• [Publications] Y.Tajima: "The Overlap Between the Thin-and Thick-Filament Reflections in the Small-Angle X-ray Diffraction Pattem From a Molluscan Smooth Muscle"J.Synchrotron Radiation. 6巻. 93-100 (1999)
• [Publications] V.James: "Using Hair to Screen for Breast Cancer"Nature. 398巻. 33-34 (1999)
• [Publications] M.Kataoka: "Structures of photointermediates and their implication to the proton pump mechanism"Biochim.Biophys.Acta. (印刷中). (2000)
• [Publications] 岡 俊彦: "バクテリオロドプシンの光反応中間体の構造とプロトンポンプ機構"放射光. 12巻. 184-193 (1999)
• [Publications] 片岡 幹雄: "中性子準弾性・非弾性散乱による蛋白質動力学の研究"波紋. 9巻3号. 19-23 (1999)
• [Publications] D.Hamada: "Evidence for the nature of rete-limiting steps in protein folding by analysis of the effects of 2,2,2-trifluoroethanol"Nature Struct.Biol.. 7巻. 58-61 (2000)
• [Publications] S.Nomura: "Ordered structure formation of bacteriorhodopsin-hDHFR in a plasma membrane"Langmuir. 15巻. 214-220 (1999)
• [Publications] T.Oka: "Conformational change of helix G in the bacteriorhodopsin photocycle:Investigation with heavy atom labeling and X-ray diffraction"Biophys.J.. 76巻. 1018-1023 (1999)
• [Publications] Y.O.Kamatari: "The compact and expanded denatured conformations of apomyoglobin in methanol-water solvent"Protein Science. 8巻. 873-882 (1999)
• [Publications] M.Kataoka: "Dynamical and structural modifications of staphylococcal nuclease on C-terminal truncation"Physica B. 266巻. 20-26 (1999)
• [Publications] M.Kataoka: "Low energy dynamics of globular proteins studied by inelastic neutron scattering"J.Phys.Chem.Solid. 60巻. 1285-1289 (1999)
• [Publications] 片岡幹雄: "中性子散乱による蛋白質動力学の研究"大阪大学低温センターだより. 102巻. 8-14 (1998)
• [Publications] 佐藤 衛: "中性子による計測と利用"日本アイソトープ協会(丸善). 260 (1999)
• [Publications] M.Arai: "Old and New Views of Protein Folding"Elsevier. 318 (1999)
• [Publications] 片岡幹雄: "結晶解析ハンドブック"共立出版. 673 (1999)
• [Publications] M.Kataoka: "Old and New Views of Protein Folding"Elsevier Science. 318 (1999)
• [Publications] 片岡幹雄: "夢の光-放射光が拓く生命の神秘"共立出版. (印刷中) (2000)