1997 Fiscal Year Annual Research Report
Arbitrarily-primed PCRを用いたMRSAのタイピング
Project/Area Number |
09670617
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Research Institution | Kagawa Medical School |
Principal Investigator |
藤田 次郎 香川医科大学, 医学部, 助手 (80209056)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
岡田 宏基 香川医科大学, 医学部・附属病院, 講師 (00243775)
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Keywords | Arbitrarily-primed PCR / MRSA / タイピング / 院内感染 |
Research Abstract |
平成9年度には、香川医科大学において検出されたMRSA臨床分離株を用いて、AP-PCR法によるタイピング確立のための基礎的検討を実施した。具体的には以下のような項目を検討した。 (1)MRSA菌株からのDNA抽出法として標準法であるlysostaphin、SDS、proteinase K処理後,phenolとchloroformにてDNAを抽出しethanolで沈殿させるという方法とIn sta Gene Purification Matrixを用いた簡便なDNA抽出法との比較。 (2)pHおよびMgCL_2濃度の変化に伴う増幅パターンの差違。 (3)primerの種類(M13 sequencing primer[TTATGTAAAACGACGGCCAGT],M13 reverse Primer[GGAAACAGCTATGACCATG],およびKZ primer[CCCATGTGTACGCGTGTGGG]など)による増幅パターンの差違。 (4)PCRの温度設定、サイクル数、一段階法または二段階法との比較。 またPulsed-field gel electrophoresis、プラスミド解析、コアグラーゼ型、および薬剤感受性などとの比較を行った。さらに確立されたAP-PCR法を用いて広くMRSAのタイピングを実施し、その有用性を証明した。またAP-PCR法によるタイピングを他の菌株(Nocardia、Pasteurellaなど)にも応用し、臨床的有用性を証明しつつある。
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Research Products
(6 results)
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[Publications] Yuka Obayashi: "Investigation of nosocomial infection due to arbekacin-resistant methicillin-resistant Staphylococcus aureus" Diag Microbiol Infect Dis. 28. 53-59 (1997)
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[Publications] Jiro Fujita: "Pneumonia caused by Pseudomonas putida with a mucoid phenotype" Respir Med. (in press).
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[Publications] Hiroshi Miyawaki: "Detection of Pneumocystis carinii sequences in serum by polymerase chain reaction:clinical application in two patients with Pneumocystis carinii pneumonia" J Infect Chemother. (in press).
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[Publications] Satoko Hojo: "Severe cystic fibrosis associated with a △F508/R347H+D979A compound heterozygous genotype" Clin Genetics. (in press).
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[Publications] Yuka Obayashi: "Clinicalfeatures of non-tuberculous mycobacterium. -Comparison between smear-positive cases and culture-positive cases,as well as comparison between Mycobacterium avium and Mycobacterium intracellulare-" Int J Tuberc Lung Dis. (in press).
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[Publications] 藤田次郎: "耐性菌感染症(単行本)" ハベカシン耐性、コアグラーゼVII型MRSAによる院内感染症(印刷中),