1997 Fiscal Year Annual Research Report

光クロスリンク-クリーベ-ジ法を用いたDNA結合オリゴペプチドの合成

Research Project

Project/Area Number	09680568
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Research Institution	Kyoto University
Principal Investigator	中谷和彦京都大学, 工学研究科, 助教授 (70237303)
Keywords	光クロスリンク基 / DNA / オリゴペプチド
Research Abstract	平成9年度はペプチド合成機を用いてペプチドライブラリーを固相担体上での作成を検討した。各ペプチドのN末端に光クロスリンク基(例ではアリールアジド)を導入し、固相担体から切り出す(step 1)。光クロスリンク基は、後でDNAとオリゴペプチドを切り離せるように細工しておく(例えば、Cbz型のカルバメートを形成し、加水素分解する)。ターゲットとするDNA(最初はオリゴマーを使う)と混合し、光照射する(step 2)。DNAに強く結合していたオリゴペプチドはこの操作によりDNAに共有結合で固定される。DNAをエタノール沈殿により回収し、非結合オリゴペプチドを除去する(step 3)。得られた「オリゴペプチド-DNA複合体」を予め設定した化学反応(例では加水素分解)を用いて、光クロスリンク基とオリゴペプチドのN末端の間で切断する(波線部分)(step 4)。再度エタノール沈殿を行い、遊離したオリゴペプチドを回収する。HPLCで精製後、オリゴペプチドを分析、再合成し、DNAとの結合を確認する。本実験工程を検証しているが、DNAに強く結合するポジティブコントロールが無いために、実験の結果を正確に評価する方法が無く、実験方法を再検討している。平成10年度は方法論を確立する事を目指す。

Research Products
(6 results)

All Other

All Publications (6 results)

[Publications] 中谷和彦: "Guantne Spectfic DNA Cleavage by Photomadiation of Dibenzoyldrazometnane-Ologonucleotide Conjugates." J.Am.Chem.Soc.119. 7626-7635 (1997)
[Publications] 中谷和彦: "Synthesis of ABC Ring Analog of karurtmyctu A3 asan Effective DNA Alkylating Agent." Angew.Chem.Int.Ed.Eng.36. 2794-2797 (1997)
[Publications] 中谷和彦: "Sequence-and conformation-Dependent Photomduced-Electron Transfer from DNA." Nucleic Acids Sym.Series.35. 8- (1996)
[Publications] 中谷和彦: "Truncated Analogs of Kapurimycin A3 and Their DNA Alkylation Mechanism." Nucleic Acids Sym.Series.35. 83-84 (1996)
[Publications] 中谷和彦: "Novel synthesis of Bifurans uia Furan-Forming photocyclization of a-Dlketones Conjugated." Tetrahedron Lett.38. 1207-1210 (1997)
[Publications] 中谷和彦: "p-Cyano Substituted Beuzophenone as an Excelleut Photophore for One-Electron Oxidation of DNA." Tetrahedron Lett.印刷中.

1997 Fiscal Year Annual Research Report

光クロスリンク-クリーベ-ジ法を用いたDNA結合オリゴペプチドの合成

Principal Investigator

中谷 和彦 京都大学, 工学研究科, 助教授 (70237303)

Research Products

[Publications] 中谷 和彦: "Guantne Spectfic DNA Cleavage by Photomadiation of Dibenzoyldrazometnane-Ologonucleotide Conjugates." J.Am.Chem.Soc.119. 7626-7635 (1997)

[Publications] 中谷 和彦: "Synthesis of ABC Ring Analog of karurtmyctu A3 asan Effective DNA Alkylating Agent." Angew.Chem.Int.Ed.Eng.36. 2794-2797 (1997)

[Publications] 中谷 和彦: "Sequence-and conformation-Dependent Photomduced-Electron Transfer from DNA." Nucleic Acids Sym.Series.35. 8- (1996)

[Publications] 中谷 和彦: "Truncated Analogs of Kapurimycin A3 and Their DNA Alkylation Mechanism." Nucleic Acids Sym.Series.35. 83-84 (1996)

[Publications] 中谷 和彦: "Novel synthesis of Bifurans uia Furan-Forming photocyclization of a-Dlketones Conjugated." Tetrahedron Lett.38. 1207-1210 (1997)

[Publications] 中谷 和彦: "p-Cyano Substituted Beuzophenone as an Excelleut Photophore for One-Electron Oxidation of DNA." Tetrahedron Lett.印刷中.

中谷和彦京都大学, 工学研究科, 助教授 (70237303)

[Publications] 中谷和彦: "Guantne Spectfic DNA Cleavage by Photomadiation of Dibenzoyldrazometnane-Ologonucleotide Conjugates." J.Am.Chem.Soc.119. 7626-7635 (1997)

[Publications] 中谷和彦: "Synthesis of ABC Ring Analog of karurtmyctu A3 asan Effective DNA Alkylating Agent." Angew.Chem.Int.Ed.Eng.36. 2794-2797 (1997)

[Publications] 中谷和彦: "Sequence-and conformation-Dependent Photomduced-Electron Transfer from DNA." Nucleic Acids Sym.Series.35. 8- (1996)

[Publications] 中谷和彦: "Truncated Analogs of Kapurimycin A3 and Their DNA Alkylation Mechanism." Nucleic Acids Sym.Series.35. 83-84 (1996)

[Publications] 中谷和彦: "Novel synthesis of Bifurans uia Furan-Forming photocyclization of a-Dlketones Conjugated." Tetrahedron Lett.38. 1207-1210 (1997)

[Publications] 中谷和彦: "p-Cyano Substituted Beuzophenone as an Excelleut Photophore for One-Electron Oxidation of DNA." Tetrahedron Lett.印刷中.