新たに見つかった核酸の2重鎖-4重鎖スイッチングの分子的基盤の解明とその利用

1998 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 09680648
• Research Institution: Yokohama National University
• Principal Investigator: 片平 正人 横浜国立大学, 工学部, 助教授 (70211844)
• Keywords: DNA / RNA / NMR / 4重鎖 / 2重鎖 / テロメア

Research Abstract

d(GGAGGA)がカリウムイオン存在下で形成する新規4重鎖構造及び同DNAがカリウムイオン非存在下で形成する新規2重鎖構造をNMRを用いて原子レベルの分解能で決定した。特に後者においては非標準的塩基対であるG:G及びA:A塩基対のみからなるユニークな構造が明らかになった。
抗ガン剤UCH9とDNAの複合体の構造をNMRにより決定し、UCH9の結合によって引き起されるB型→A型の構造変化及びその生物学的意義を明らかにした。
RNA結合蛋白質hnRNP DOとMusashi1の立体構造をNMRにより決定し、さらにこれらによって引き起される核酸の4重鎖-1重鎖スイッチングをはじめて同定した。この活性とテロメアDNA維持機構との関連についても知見を得た。

Research Products

• [Publications] Katahira 他: "Structure and interactions with RNA of the N-terminal UUAG-Specific domain of hnRNPDO" J.Mol.Biol.287. 221-237 (1999)
• [Publications] Katahira 他: "Structmre,backbone dynamics and interactions with RNA of the C-terminal RNA・binding domain of Musashi 1" J.Mal.Biol.287. 314-330 (1999)
• [Publications] Katahira 他: "Two metal binding sites in a leabd ribozyme bound to competitiuely by Pb^<2+> and Mg^<2+>" Eur.J.Biochem.255. 727-733 (1998)
• [Publications] Katahira 他: "Structural chara cterization of a DNA duplex modeled on the polypurine tract" Nucleosides & Nucleotides. 17. 831-841 (1998)
• [Publications] Katahira 他: "Solution Structure of the novel antitumor drug,VCHq,complexed with dCTTGGCC.AAI_2 by NMR" Nucleic Acids Res.26. 744-755 (1998)
• [Publications] Katahira 他: "Actiration and repression of the activity of a lead ribozyme by the combination of Pb^<2+> and Mg^<2+>" J.Biochem. 122. 1062-1067 (1997)