1999 Fiscal Year Annual Research Report
Project/Area Number |
09877386
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
大越 基弘 東京大学, 医学部・附属病院・分院, 助教授 (80022888)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
森 良之 東京大学, 医学部・附属病院, 講師 (70251296)
椎葉 正史 千葉大学, 医学部・附属病院, 助手 (20301096)
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Keywords | 舌癌 / 完全長cDNAライブラリー / ケラチン遺伝子 |
Research Abstract |
本年度は、オリゴキャップ法による完全長cDNAライブラリー作成法の条件検討を進め、少量のサンプルからの、作成が可能になった。この改良法を用い、正常舌、及び舌癌について、オリゴキャップ法によるcDNAライブラリーの作製を行った。その結果、両者とも平均鎖長が約2000bpのライブラリーが得られた。独立に得られたクローンは約6x10^5である。それぞれのライブラリーから、各288クローンをランダムに分離し、5'端シークエンスを行ったところ、正常舌よりのcDNAライブラリーについて25クローンの、舌癌よりのcDNAライブラリーについて241クローンの5'端配列が得られた。これらの配列につき、既存のデータベースを用い相同性解析を行ったところ、既知の遺伝子と一致するクローンが正常で251クローン中170、舌癌で241クローン中149であった。また、これらの既知遺伝子のcDNAにつき完全長率を見たところ、正常が92.2%、舌癌で88.4%であった。 さらに、それぞれのライブラリーでのクローンの出現頻度を既知のものについて、検討を加えた。それぞれのライブラリーから配列が得られた数が251と241であるので、統計学的に有意な結果ではないが、いくつかの興味有る知見が得られた。1)ケラチン遺伝子は4,6,13のそれぞれ型が両者に発現しているが、癌と正常を比べると6,13型は頻度が変わらないものの、4型は、癌で正常の5分の1に減っていた。このためケラチン遺伝子全体の発現も癌で低くなっている。2)正常で舌で発現の高いLIMタンパク質遺伝子が癌で発現がない。このような、舌癌と正常舌組織との遺伝子発現の差は、今後このライブラリーからのクローンの配列決定を進めることで、さらに多数見いだされてくるものと期待される。
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[Publications] Ohkoshi,M. and Fujii,S.: "Effect of synthetic Protease inhibitor [N,N-Dimethylcarbamoyl ・・・・・・・ in skin"J. Natl, Cancer Res.. 71(5). 1053-1057 (1983)
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[Publications] Ohkoshi,M. and Nakajima M.: "Effect of serin protease inhibitor FOY-305 and heparin on the growth of squamous cell carcinoma"Anticancer Res.. 13. 963-966 (1993)
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[Publications] Ohkoshi,M. and Hiwasa,T: "Growth-suppressive activity S of serine protease inhibitors, FOY-305, ONO-3403 toward human ca, cells"Oncology Rep.. 4. 521-523 (1997)
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[Publications] Ikeda,T.・・・ Ohkoshi,M. and Saiki,I: "Anti-invasive activity of synthetic serine protease inhibitor and its combined effect with a matrix metalloprotease inhibit"Anticancer Res.. 18. 4259-4266 (1998)
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[Publications] Hiwasa,T.・・・ Ohkoshi: "Potent growth-suppressive activity of a serine protease inhibitor,ONO-3403,toward malignant ・・・."Cancer Let.. 126.