1997 Fiscal Year Annual Research Report
| Project/Area Number |
09878115
|
|---|
| Research Institution | Tokyo Institute of Technology |
|---|
Principal Investigator |
関根 光雄 東京工業大学, 生命理工学部, 助教授 (40111679)
|
|---|
| Keywords | ベント構造 / コンホメーション / 3'-endo / シクロウリジル酸 / 立体異性体 / tRNA / 固相合成 / リン酸トリエステル |
|---|
| Research Abstract |
本研究は、核酸分子を人為的に折り曲げる新しい手法を開発することを目的とするものである。まず、核酸に、ベント構造を組み込むため、ベントする位置にコンホメーションを固定したヌクレオチドユニットの合成が必要である。そのため、tRNAの三次元構造からヒントを得て、ウリジル酸の塩基部位の5位と5'リン酸基との間にリンカーを導入し、最もリボース部位がRNA型のC3'endo型に固定した環状ウリジル酸とその上流にさらに2'-O-メチルウリジンを縮合させ、環状構造を下流のウリジンに存在するUmpUm誘導体を合成した。この2量体にはリン酸トリエステル構造が生じるため、Rp体とSp体のジアステレオマ-が得られた。これらの立体異性体は各々分離精製することができた。それぞれの立体異性体の2量体の3'末端にアミダイト基を導入し、Rp体とSp体の2量体のアミダイト合成ユニットを合成した。このリン酸エステル結合の立体が固定された合成ユニットを通常のオリゴヌクレオチドの固相合成に用いることによって、デカチミジル酸とデカウリジル酸の真ん中の位置に導入し、Rp体とSp体の立体をもつデカチミジル酸とデカウリジル酸をそれぞれ合成することができた。相補的なdA_<10>とA_<10>とハイブリダイゼーション能力を調べる、その安定性比較することによって、Rp体とSp体の立体を決定した。この結果、Sp体の立体をもつオリゴヌクレオチドが核酸を曲げることのできる立体をもつことがわかった。
|
Research Products
(6 results)
-
[Publications] T.Wada, Y.Sato, F.Honda, S.Kawahara, M.Sekine: "Chemical Synthesis of Oligodeoxyribonucleotides Using N-Unprotected H-Phosphonate Monomers and Carbonium and Phosphoniun Condensing Reagents" Journal of American Chemical Society. 119・52. 12710-12721 (1997)
-
[Publications] H.Tsuruoka, K.Shohda, T.Wada, M.Sekine: "Kinetics and Mechanism of Facile and Selective Dephosphorylation of 2'-Phosphorylated and 2'-Thiophosphorylated Dinucleotides" Journal of Organic Chemistry. 62・9. 2813-2822 (1997)
-
[Publications] K.Seio, T.Wada, k.Sakamoto, S.Yokoyama, M.Sekine: "Chemical Synthesis and Properties of Conformationally Fixed Diuridine Monophosphates as Building Blocks of RNA Turn Motif" Journal of Organic Chemistry. (印刷中).
-
[Publications] M.Kadokura, T.Wada, C.Urashima, M.Sekine: "Effective Synthesis of γ-Methyl-Capped Guanosine 5'-Triphosphate as a 5'-Terminal Unique Structure of U6 RNA vi a New Triphosphate Bond Formation" Tetrahedron Letters. 38・48. 8359-8362 (1997)
-
[Publications] T.Wada, F.Honda, Y.Sato, S.Kawahara, M.Sekine: "Chemical Synthesis of H-Phosphonate DNA without Using N-Protecting Groups" Nucleic Acids Symposium Series. 37. 19-20 (1997)
-
[Publications] K.Seio, O.Kurasawa, T.Wada, M.Sekine, et al.: "Synthesis and Properties of Conformationally Rigid Cyclouridylic Acids Having Covalent Bond Between the Uracil 5-Position and the 5'-Phosphate Group" Nucleoside Nucleotides. 16・7-9. 1023-1032 (1997)
