1998 Fiscal Year Annual Research Report

イモリにおける遺伝子発現とゲノム上の遺伝子の分布

Research Project

Project/Area Number	09878154
Research Institution	Kobe University
Principal Investigator	磯野克己神戸大学, 理学部, 教授 (70011640)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	阿形清和姫路工業大学, 理学部, 助教授 (70167831) 北川円神戸大学, 理学部, 助手 (70169853)
Keywords	イモリ / cDNA / YACクローン / 塩基配列
Research Abstract	本研究ではゲノムが特に大きい両生類であるアカハライモリ(Cynops pyrrhogaster)を対象として、生物におけるゲノム情報構造とその発現の仕組みに関する新しい知見を得ることを目的とし,そのための第一歩としてこの生物のゲノム構造の一端を解析するべく企画立案した。過去2年間、まず(1)野外からアカハライモリの幼生を多数採集して凍結保存し、それらの幼生の細胞からイモリのcDNAを抽出してクローンバンクを作成し,得られたクローンの塩基配列を決定することにより,イモリで実際に発現している遺伝情報をできるだけ多く解析して他の生物種と比較することを試みた。しかし、イモリからのDNA抽出やcDNA作製の過程で予期しなかったようないろいろな問題が生じて手間取り、あまり多くのcDNAクローンについての解析が進められなかった。またこれと平行して,(2)イモリの染色体DNAのYACクローンバンクを作成し、両者の組織的なハイブリッド形成を調べることにより、発現している遺伝子のYACクローン上の分布を詳細に解析することも計画した。この線に添って一応かなりの数のYACクローンは作製できたが、cDNAクローンの方に問題があって、それらの解析はあまり進んでいない。さらに,(3)できるだけ多くのcDNAについてそのゲノムDNAクローンを作成し,エキソンやイントロンの解析を進める予定であったが、これについても同様の理由であまり進められなかった。今後、方法を改善してcDNAクローンバンクの作製を進め、本研究で得られているYACクローンを用いて当初予定した解析を継続的に進めていく予定である。

Research Products
(10 results)

All Other

All Publications (10 results)

[Publications] Yamamoto,Y.,et al.: "Construction of a contiguous 874 kb sequence of the Escherichia coli K12 genome correspond-ing to 50.0-68.8 min region on the linkage map and analysis of its sequence features." DNA Research. 4. 91-113 (1997)
[Publications] Kitakawa,M.et al.: "Identification and characterization of the genes for mitochondrial ribosomal proteins of Saccharomyces cerevisiae" Eur.J.Biochem.245. 449-456 (1997)
[Publications] Hirosawa,M.et al.: "Gene identification and classification in the Synechocystis genomic sequence by recursive GeneMark analysis" DNA Sequence. 8. 17-30 (1997)
[Publications] Baba,T.,& Isono,K.: "Identification of likely genes on chromosome VI of Saccharomyces cerevisiae by correlating transcripts and nucleotide sequence data." DNA Research. 4. 205-213 (1997)
[Publications] Goffeau,A.,et.al.: "The yeast genome directry." Nature(Supple). 387. 1-105 (1997)
[Publications] Wang,W.-Y.et al.: "Isolation and characterization of Saccharomyces cerevisiae genes differentially expressed under different growth conditions" J.Gen.Appl.Microbiol.47. 217-224 (1997)
[Publications] Hirosawa,M.,& Isono,K.: "GeneMark-RC,a recursive procedure for gene identification in the genomic seequence data with self-consistency evaluation;its application to the analysis of several prokaryotic genomes." Proceedings of Genome Informatics Workshop. 8. 197-113 (1997)
[Publications] Fujita,K.et al.: "Genomic analysis of the genes encoding ribosomal proteins in eight eubacterial species and Saccharomyces cerevisiae." Proceedings of Genome Informatics Workshop. 9. 3-12 (1998)
[Publications] Kasai,H.et al.: "ICB,a database that facilitates easier identification and classification of bacteria through the analysis of gyrB and other protein-coding genes" Proceedings of Genome Informatics Workshop. 9. 13-21 (1998)
[Publications] Moriya,H.,& Isono,K.: "Analysis of genetic interactions between DHHI,SSDI and ELMI indicates their possible involvement in cellular morphology determination in Saccharomyces cerevisiae." Yeast. (in press). (1998)

1998 Fiscal Year Annual Research Report

イモリにおける遺伝子発現とゲノム上の遺伝子の分布

Principal Investigator

磯野 克己 神戸大学, 理学部, 教授 (70011640)

Research Products

[Publications] Yamamoto,Y.,et al.: "Construction of a contiguous 874 kb sequence of the Escherichia coli K12 genome correspond-ing to 50.0-68.8 min region on the linkage map and analysis of its sequence features." DNA Research. 4. 91-113 (1997)

[Publications] Kitakawa,M.et al.: "Identification and characterization of the genes for mitochondrial ribosomal proteins of Saccharomyces cerevisiae" Eur.J.Biochem.245. 449-456 (1997)

[Publications] Hirosawa,M.et al.: "Gene identification and classification in the Synechocystis genomic sequence by recursive GeneMark analysis" DNA Sequence. 8. 17-30 (1997)

[Publications] Baba,T.,& Isono,K.: "Identification of likely genes on chromosome VI of Saccharomyces cerevisiae by correlating transcripts and nucleotide sequence data." DNA Research. 4. 205-213 (1997)

[Publications] Goffeau,A.,et.al.: "The yeast genome directry." Nature(Supple). 387. 1-105 (1997)

[Publications] Wang,W.-Y.et al.: "Isolation and characterization of Saccharomyces cerevisiae genes differentially expressed under different growth conditions" J.Gen.Appl.Microbiol.47. 217-224 (1997)

[Publications] Hirosawa,M.,& Isono,K.: "GeneMark-RC,a recursive procedure for gene identification in the genomic seequence data with self-consistency evaluation;its application to the analysis of several prokaryotic genomes." Proceedings of Genome Informatics Workshop. 8. 197-113 (1997)

[Publications] Fujita,K.et al.: "Genomic analysis of the genes encoding ribosomal proteins in eight eubacterial species and Saccharomyces cerevisiae." Proceedings of Genome Informatics Workshop. 9. 3-12 (1998)

[Publications] Kasai,H.et al.: "ICB,a database that facilitates easier identification and classification of bacteria through the analysis of gyrB and other protein-coding genes" Proceedings of Genome Informatics Workshop. 9. 13-21 (1998)

[Publications] Moriya,H.,& Isono,K.: "Analysis of genetic interactions between DHHI,SSDI and ELMI indicates their possible involvement in cellular morphology determination in Saccharomyces cerevisiae." Yeast. (in press). (1998)

磯野克己神戸大学, 理学部, 教授 (70011640)