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2010 Fiscal Year Annual Research Report

心水症の予防・制圧に向けた分子生態解析

Research Project

Project/Area Number 09J04584
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

中尾 亮  北海道大学, 大学院・獣医学研究科, 特別研究員(DC1)

Keywords心水症 / E.ruminantium / LAMP法 / 遺伝子型別 / MLVA法 / 次時代シーケンサー / SNP / ゲノム比較解析
Research Abstract

【Ehrlichia ruminantium遺伝子検出法の開発】ウガンダ・タンザニア・ザンビア・ガンビアの心水症流行国で採取した家畜血液・媒介マダニサンプルを用いて、昨年度開発したE.ruminantiumを特異的に検出するLAMP法の有用性を評価した。その結果、PCR法よりも多くの陽性検体を検出し、また不顕性感染個体の血液からも検出が可能であったことから、本LAMP法は疫学研究ならびに感染家畜の診断・摘発に有効な手法であることが示された。本研究結果は、国際学術雑誌BMC Microbiologyに掲載された。【E.ruminantium遺伝子型別法の開発】昨年度開発したMLVA法を用いてウガンダの心水症流行地で採取されたマダニから検出したE.ruminantiumの遺伝子型別を行った。その結果、本法は既存の遺伝子型別法(PCR-RFLP法)に比べ詳細な型別が可能であり、クラスター解析によって株の分離地の推定にも応用できることが示された。今後、ワクチン導入前における野外株の集団遺伝学的解析に活用することで、流行地での有効なワクチン処方に貢献することが期待できる。【E.ruminantiumのSNP解析】次世代シーケンサー(Illumina Genome analyzer II)を活用してE.ruminantiumの西アフリカ由来株(Sankat、Pokoase、Kerr Seringe株)のゲノムを解読し、reference-guided assembly法によるマッピング後、各株に特異的なSNPを検出した。今年度、Sankat、Pokoase株の分離された地域(ガーナ)での野外株採取を計画しており、今回得られたSNP情報を野外におけるE.ruminantium株間の遺伝子相同組み換え、各遺伝子の進化速度の評価に活用する予定である。

  • Research Products

    (6 results)

All 2010

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] Development of Loop-Mediated Isothermal Amplification (LAMP) Assays for Rapid Detection of Ehrlichia ruminantium2010

    • Author(s)
      中尾亮
    • Journal Title

      BMC Microbiology

      Volume: 10

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Ehrlichia ruminantium多型解析のためのMulti-Locus Variable Number Tandem Repeat Analysis(MLVA)法開発2010

    • Author(s)
      中尾亮
    • Organizer
      第56回日本寄生虫学会・日本衛生動物学会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      20101002-20101003
  • [Presentation] Ehrlichia ruminantium多型解析のためのMulti-Locus Variable Number Tandem Repeat Analysis(MLVA)法の開発2010

    • Author(s)
      中尾亮
    • Organizer
      第150回日本獣医学会学術集会
    • Place of Presentation
      帯広畜産大学(帯広市)
    • Year and Date
      20100916-20100918
  • [Presentation] Whole-genome analysis of an attenuated Ehrlichia ruminantium vaccine strain using next-generation sequencer2010

    • Author(s)
      中尾亮
    • Organizer
      The 2nd International Young Researcher Seminar in Zoonosis Control 2010
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌市)
    • Year and Date
      20100913-20100914
  • [Presentation] Whole-genome analysis of an attenuated Ehrlichia ruminantium vaccine strain using next-generation sequencer2010

    • Author(s)
      中尾亮
    • Organizer
      XIIth International Congress of Parasitology (ICOPA)
    • Place of Presentation
      Melbourne Convention & Exhibition Centre (Melbourne, Australia)
    • Year and Date
      20100815-20100820
  • [Presentation] 次世代シーケンサーによるEhrlichia ruminantium 弱毒ワクチン株の全長ゲノム解読と弱毒化機序の遺伝的背景の解析2010

    • Author(s)
      中尾亮
    • Organizer
      第18回ダニと疾患のインターフェースに関するセミナー
    • Place of Presentation
      トキ交流会館(新潟県佐渡市)
    • Year and Date
      20100611-20100613

URL: 

Published: 2012-07-19  

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