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2010 Fiscal Year Annual Research Report

無細胞翻訳系による炭素-炭素結合形成技術の確立

Research Project

Project/Area Number 09J09079
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

森本 淳平  東京大学, 大学院・理学系研究科, 特別研究員(DC1)

Keywords翻訳合成 / ハイスループットスクーニニング / SIRT2 / ペプチド
Research Abstract

本研究では、炭素-炭素結合形成をリボソーム内で行うことでアミド結合だけではないより多様性の高い構造を持つ化合物を翻訳で合成する技術を確立し、高い多様性の化合物ライブラリーを迅速に構築しスクリーニングできるという翻訳系の利点を活かして、生理活性化合物探索を加速させることを目指していた。
前年度の報告では、炭素-炭素結合形成を試みたものの目的の達成には至らず、代わりに主鎖はアミド結合であるものの側鎖に非天然型の構造を有する特殊アミノ酸を導入したペプチドライブラリーを構築し、翻訳後修飾酵素を標的とした阻害剤探索を行った。具体的には、脱アセチル化酵素の一種であるSIRT2を標的とし、すでに標的の活性部位に結合して阻害効果を発揮することが知られているトリフルオロアセチルリシン残基(TfaLys.Z)を含むペプチドライブラリーからのスクリーニングを行った。その結果、TfaLys周辺に高い相同性を持つペプチド配列群が得られた。本年度は、これらの配列の中から2つのペプチド配列を選んで固相上で合成し、その活性を以下に述べる方法で調べた。
まず、上記2つのペプチドの標的酵素SIRT2への結合能をSPR(Surface Plasmon Resonance)法によって測定した。この結果、いずれのペプチドもK_d≒4nMという非常に強い結合能を示すことが明らかとなった。続いて、蛍光を指標としたin vitroのSIRT2活性測定キットを用いてペプチドの阻害能を調べたところ、いずれのペプチドもK_dとほぼ一致するIC_<50>≒3nMという強い阻害能を示した。さらに同様のアッセイによって、SIRT1とSIRT3に対する阻害活性も評価したところ、いずれのペプチドもSIRT2特異的であることが明らかとなった。
以上のように本年度の実験から、スクリーニングで得られたペプチドが少なくともin vitroでは非常に強くかつ特異的にSIRT2を阻害することが明らかとなった。

  • Research Products

    (6 results)

All 2010

All Journal Article (1 results) Presentation (4 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Accelerating the discovery of nonstandard peptide inhibitors against a deacetylase powered by the RaPID display2010

    • Author(s)
      Morimoto, J., Suga, H.
    • Journal Title

      Peptide Science 2010

      Volume: (in press 掲載確定)

  • [Presentation] Development of sirtuin inhibitor peptides via reprogramming the genetic code2010

    • Author(s)
      Jumpei Morimoto, Hiroaki Suga
    • Organizer
      PACIFICHEM 2010
    • Place of Presentation
      Hawaii Convention Center
    • Year and Date
      2010-12-17
  • [Presentation] Accelerating the discovery of nonstandard peptide inhibitors against a deacetylase powered by the RaPID display2010

    • Author(s)
      Jumpei Morimoto, Hiroaki Suga
    • Organizer
      5^<th> Internationa Peptide Symposium
    • Place of Presentation
      国立京都国際会館
    • Year and Date
      2010-12-08
  • [Presentation] 遺伝暗号のリプログラミングを利用した特殊ペプチドライブラリーの構築と酵素阻害剤の取得2010

    • Author(s)
      森本淳平、菅裕明
    • Organizer
      日本化学部会生体機能関連化学部会 第25回若手フォーラム
    • Place of Presentation
      大阪大学
    • Year and Date
      2010-09-23
  • [Presentation] 遺伝暗号のリプログラミングを利用した脱アセチル化酵素阻害剤の開発2010

    • Author(s)
      森本淳平、菅裕明
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会 第5回年会
    • Place of Presentation
      慶應義塾大学
    • Year and Date
      2010-05-18
  • [Patent(Industrial Property Rights)] Methods for library synthesis of peptides containing functional specific small molecules and their screening of active species2010

    • Inventor(s)
      菅裕明、森本淳平
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京大学
    • Industrial Property Number
      特願2010-270507(日本)
    • Filing Date
      2010-12-03

URL: 

Published: 2012-07-19  

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