1998 Fiscal Year Annual Research Report
遺伝子と種の進化における遺伝子間ホモロジー相互作用
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10044062
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| Research Category |
Grant-in-Aid for international Scientific Research
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| Section | Joint Research . |
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
小林 一三 東京大学, 医科学研究所, 助教授 (30126057)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
コワルチコウスキー ステ カリフォルニア大学, デイビス校, 教授
ラドマン ミロスラブ パリ大学, ジャック・モノー研究所, 教授
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| Keywords | ゲノム / 相同組換え / ミスマッチ修復 / 制限修飾系 / DNA修復 / DNA複製 / 生殖隔離 / 種分化 |
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| Research Abstract |
(1) 制限修飾系の分離後宿主殺し(小林)。
制限修飾遺伝子による宿主染色体切断と細胞の形態変化を検討した。
(2) 制限修飾系への対応戦略としての相同組換え(小林)
A.宿主のRecBCD/RecA分解組換え系。
細胞死と染色体切断への大腸菌の相同組換えに関与する遺伝子とくにrecBCD,recA
の影響を解明した。1acZレポーターで高いSOS応答を定量した。
B.バクテリオファージの反制限修飾遺伝子としての相同組換え系。
バクテリオファージラムダのもつ組換え機構と類縁ファージの組換え機構が、in vivoでの制限酵素による攻撃を修復することを示した。
(3) In vitro系。(SK)
RecC1004変異酵素が、カイ配列を認識しないことを示した。
カイスター配列と、RecC1004変異酵素および野生型RecBCD酵素の相互作用を解析し、カイスターがユニークな認識配列であることを示した.
(5) ミスマッチ認識系と疑似相同組換え。(MR)
ミスマッチ修復機能を、広い範囲で上下させるような条件での、相同組換え、疑似相同組換えの、反応効率、反応産物を解析した。
大腸菌のエイジングしているコロニーで、変異生成を証明した。
(6) 相同組換え頻度の理論。(小林)
ランダムウォークモデルをミスマッチによる破壊を含む場合へ一般化し、ミスマッチ認識酵素の変異による不在およびその過剰発現が、相同組換え頻度のホモロジー長さ依存性、ホモロジーの完全さへの依存性に及ぼす影響を解析したRadmanらのデータの説明に成功した。
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[Publications] Handa,N.: "Host responses to post-segregational killing by restriction-modification genes." Mol.Microbiol.(in press).
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[Publications] Kobayashi,I.: "Selfish behavior of restriction-modification gene complexes and host defense by homologous recombination." Proceedings of the fifth worldwide internet conference INABIS‘98(CD-ROM publication). (in press).
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[Publications] Kobayashi,I.: "Homologous recombination and sex as a strategy against selfish genetic elements attacking genome." Ann.New York Acad.Sci.(in press).
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[Publications] Kobayashi,I.: "Selfishness and death: raison d'e^^<^>tre of restriction,recombination and mitochondria." Trends in Genetics. 14. 368-374 (1998)
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[Publications] Naito,Y.: "Selfish restriction modification genes: Resistance of a resident R/M plasmid to displacement by an incompatible plasmid mediated by host killing." Biol.Chem.379. 429-436 (1998)
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[Publications] Nakayama,Y.: "Restriction-modification gene complexes as selfish gene entities: Roles of a regulatory system in their establishment,maintenance,and apoptotic mutual exclusion." Proc.Nat.Acad.Sci.USA. 95. 6442-6447 (1998)
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[Publications] Fujitani,Y.: "Mismatch-stimulated destruction of intermediates as an explanation for map expansion in genetic recombination." J.Theor.Biol.189. 443-447 (1997)
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[Publications] Handa,N.: "Selfish behavior in restriction and recombination." J.Reproduction and Development. 43. 59-60 (1997)
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[Publications] Kobayashi,I.: "Genetic recombination in fights between selfish genes." J.Reproduction and Development. 43. 61-62 (1997)
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[Publications] 半田直史: "ゲノムにとっての自己と非自己" 臨床免疫. (刊行中).
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[Publications] 小林一三: "反「利己的遺伝子」戦略としての性" 遺伝. 52. 27-33 (1998)
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[Publications] Kobayashi,I.: "DNA double-strand break repair in bacteria,in Encyclopedia of Life Sciences." Macmillan,London(in press),
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[Publications] Kusano-Fujita,A.: "Mutation correction by homologous recombination with a replication-defective adenovirus vector.,in Gene Therapy Vector Protocols Handbook" Humana Press,Totowa,NJ,USA(in press),
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[Publications] Kobayashi,I.: "Plasmid maintenance systems,in Plasmid Biology" Harwood academic publishers gmbh,Amsterdam, (1998)
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[Publications] 内藤泰宏: "相同組換え法による遺伝子導入 in 遺伝子治療開発研究ハンドブック" エヌ・ティー・エス(刊行中),
