1999 Fiscal Year Annual Research Report

DNA精密分子認識機構の解明についての共同研究

Research Project

Project/Area Number	10044134
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Research Institution	Tokyo Medical and Dental University
Principal Investigator	杉山弘東京医科歯科大学, 生体材料工学研究所, 教授 (50183843)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	伊藤茂東京医科歯科大学, 生体材料工学研究所, 助手 (70143609) 杉本昭子東京医科歯科大学, 生体材料工学研究所, 助手 (60143608)
Keywords	抗がん剤 / 抗生物質 / 塩基配列特異性 / DNAアルキル化 / グルーブバインダー / 分子認識
Research Abstract	ディスタマイシン存在下のデュオカルマンの協同的アルキル化の機構を明らかにするため、イリノイ大学において磁気共鳴スペクトルを用いて複合体の構造を解析した。また、東京医科歯科大学において、ケイ光スペクトル、熱量測定などの分光学的手法を駆使して速度論を中心に解析を行なった。さらにデュオカルマイシンによるアルキル化の塩基配列選択性の制御をする目的で様々なグルーブバインダー存在下の反応を解析した。デュオカルマイシンによる協同的アルキル化はパートナーである分子のDNA副溝内での水素結合によって支配されているので、東京医科歯科大学において種々の水素結合を改変したアルキル化分子を化学合成して、アルキル化の配列選択性を解析し、その分子認識について体系化を試みた。

Research Products
(6 results)

All Other

All Publications (6 results)

[Publications] Zhang, Q-M.; Sugiyama, H.; Miyabe, I.; Matuda, S.; Kino, K.; Saito, I.; Yonei, S.: "Replication in vitro and Cleavage by Restriction Endonuclease of 5-Formyluracil-and 5-Hydroxymethyluracil-Containing Oligonucleotides."Int. J. Radiat. Biol.. 75. 59-65 (1999)
[Publications] Tao, Z.-F.; Fujiwara, T.; Saito, I.; Sugiyama, H.: "Rational Design of Sequence-Specific DNA Alkylating Agents Based on Duocarmycin A and Pyrrole-Imidazole Hairpin Polyamides."J. Am. Chem. Soc.. 121. 4961-4967 (1999)
[Publications] Kawai, K.; Saito, I.; Kawashima, E.; Ishido, Y.; Sugiyama, H.: "Intrastrand 2'β Hydrogen Abstraction of 5'-Adjacent Deoxyguanosine by Deoxyuridin-5-yl in Z-form DNA."Tetrahedron Letters. 40. 2589-2592 (1999)
[Publications] Kawai, K.; Saito, I.; Sugiyama, H.: "Photochemical Halogen-Exchange Reaction of 5-lodouracil-Containing Oligonucleotides."Tetrahedron Letters. 40. 5721-5724 (1999)
[Publications] Fujiwara, T.; Tao, Z-F.; Ozeki, Y.; Saito, I.; Wang, A.H.-J.; Lee, M.; Sugiyama,H.: "Modulation of Sequence Specificity of Duocarmycin-Dependent DNA Alkylation by Pyrrole-Imidazole Triamides."J. Am. Chem. Soc.. 121. 7706-7707 (1999)
[Publications] Yang, X.-L.; Hubbard IV, R. B.; Lee, M.; Tao, Z.-F.; Sugiyama, H.; Wang, H.-J.: "Imidazole-imidazole pair as a minor groove recognition motif for T:G mismatched base pairs."Nucleic Acids Res.. 27. 4183-4190 (1999)

1999 Fiscal Year Annual Research Report

DNA精密分子認識機構の解明についての共同研究

Principal Investigator

杉山 弘 東京医科歯科大学, 生体材料工学研究所, 教授 (50183843)

Research Products

[Publications] Zhang, Q-M.; Sugiyama, H.; Miyabe, I.; Matuda, S.; Kino, K.; Saito, I.; Yonei, S.: "Replication in vitro and Cleavage by Restriction Endonuclease of 5-Formyluracil-and 5-Hydroxymethyluracil-Containing Oligonucleotides."Int. J. Radiat. Biol.. 75. 59-65 (1999)

[Publications] Tao, Z.-F.; Fujiwara, T.; Saito, I.; Sugiyama, H.: "Rational Design of Sequence-Specific DNA Alkylating Agents Based on Duocarmycin A and Pyrrole-Imidazole Hairpin Polyamides."J. Am. Chem. Soc.. 121. 4961-4967 (1999)

[Publications] Kawai, K.; Saito, I.; Kawashima, E.; Ishido, Y.; Sugiyama, H.: "Intrastrand 2'β Hydrogen Abstraction of 5'-Adjacent Deoxyguanosine by Deoxyuridin-5-yl in Z-form DNA."Tetrahedron Letters. 40. 2589-2592 (1999)

[Publications] Kawai, K.; Saito, I.; Sugiyama, H.: "Photochemical Halogen-Exchange Reaction of 5-lodouracil-Containing Oligonucleotides."Tetrahedron Letters. 40. 5721-5724 (1999)

[Publications] Fujiwara, T.; Tao, Z-F.; Ozeki, Y.; Saito, I.; Wang, A.H.-J.; Lee, M.; Sugiyama,H.: "Modulation of Sequence Specificity of Duocarmycin-Dependent DNA Alkylation by Pyrrole-Imidazole Triamides."J. Am. Chem. Soc.. 121. 7706-7707 (1999)

[Publications] Yang, X.-L.; Hubbard IV, R. B.; Lee, M.; Tao, Z.-F.; Sugiyama, H.; Wang, H.-J.: "Imidazole-imidazole pair as a minor groove recognition motif for T:G mismatched base pairs."Nucleic Acids Res.. 27. 4183-4190 (1999)

杉山弘東京医科歯科大学, 生体材料工学研究所, 教授 (50183843)