カリウムイオンによるDNAの構造遷移を利用したリボザイム活性のスイッチング

1998 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 10129205
• Research Institution: Yokohama National University
• Principal Investigator: 片平 正人 横浜国立大学, 工学部, 助教授 (70211844)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 上杉 晴一 横浜国立大学, 工学部, 教授 (70028851)
• Keywords: リボザイム / DNA / 金属イオン / NMR / 立体構造 / RNA / 蛋白質

Research Abstract

鉛リボザイムにおける金属イオン(鉛イオン及びマグネシウムイオン)の結合部位をNMRにより同定した。結合部位は2カ所あり、この各々に2つの金属イオンが競争的に結合する事がわかった。そしてこの知見に基ずいて、様々な金属イオンの組み合わせによる、切断活性の増進及び抑制を統一的に理解できるモデルを提出した。
又DNA結合性の抗ガン剤VCH9とDNAの複合体の構造決定、RNA結合性の蛋白質hmRNPDφ及びMusashi1の構造決定も行い、核酸構造の遷移と生物学的活性との相関について明らかにした。

Research Products

• [Publications] Katahira 他: "Two metal binding sites in a lead ribozyme bound to competitively by Pb^<2+> and Mg^<2+>" Eur.J.Biochem.255. 727-733 (1998)
• [Publications] Katahira 他: "Solution structule of the novel antitumor drug,UCN9,complexed with q(TTGGCCAA)_2 by NMR" Nucleic Acids Res.26. 744-755 (1998)
• [Publications] Katahira 他: "Structure and interactions with RNA of the N-terminal UVAG-specitic domain of hnRNPDO" J.Mal.Biol.287. 221-237 (1999)
• [Publications] Katahira 他: "Structure,backbone dynamics and inteructions with RNA of the c-termial RNA-binding domain of Musashi 1" J.Mal.Biol.287. 314-330 (1999)
• [Publications] Katahira 他: "Structural characteristics of a DNA duplex modeled on the polypurine tract" Nucleosides & Nucleotides. 17. 831-841 (1998)
• [Publications] Katahira 他: "Duplex structure with a symmetric G : G base pairs" Nucleic Acids Symp.Ser.39. 119-120 (1998)