2000 Fiscal Year Annual Research Report
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10460027
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| Research Institution | National Institute of Radiological Sciences |
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Principal Investigator |
三田 和英 放射線医学総合研究所, 第2研究グループ, 研究員 (30159165)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
嶋田 透 東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教授 (20202111)
根井 充 放射線医学総合研究所, 生物影響研究部, 研究員 (10164659)
沼田 幸子 放射線医学総合研究所, 生物影響研究部, 研究員 (40158754)
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| Keywords | カイコ / 多細胞系モデル生物 / cDNAカタログ化 / ESTデータベース / cDNAライブラリー / 遺伝子分類 / 遺伝子発現プロフィール |
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| Research Abstract |
本研究の目的は多細胞生物系のモデル生物としてのカイコの全遺伝子を同定し、特に多細胞系特有の遺伝子を同定するとともに、将来のカイコゲノム解析のためのESTデータベースを構築し、遺伝子ライブラリーの整備をおこなうことである。このため、カイコのcDNAカタログ化を進めた。平成12年度までに30種類のcDNAライブラリー(様々な組織・発生段階から作成)から24,000cDNAクローンの塩基配列(EST)を決定し、8,500遺伝子を同定した。これはカイコの全遺伝子の40%以上をカバーする。これらのESTはホモロジー検索を行って遺伝子分類し、カイコESTデータベースとしてまとめた。また、遺伝子分類とともに各ライブラリーでの遺伝子発現頻度を示す遺伝子発現プロフィールも同時に解析するプログラムを作製し、機能的ESTデータベースを構築するという成果をあげた。これまでに多細胞系特有の遺伝子としてアポトーシス関連、神経系関連、発生・分化関連、性決定に関わる遺伝子、ホルモン制御関連、概日リズム関連遺伝子など多数の興味ある遺伝子が同定されている。これらESTのうち14,500を公共データベースDDBJ/GenBank/EMBLに登録し、公開した。また、全ESTデータベースを'SilkBase'吐してインターネット上でhttp://www.ab.a.u-tokyo.ac.jp/silkbaseのサイトで公開し、国内外の多数の研究者や企業が連続的にサーバーへアクセスしてきている。さらに、本ESTデータベースをもとに、ESTマイクロアレイ作成やBACコンティーグによる遺伝子地図作成への研究へと飛躍的に発展している。
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[Publications] Toyoshi Yoshiga: "cDNA cloning of acyl-Co A desaturose homotogs in the silk worm, Bombyx mori"Gene. 246. 339-345 (2000)
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[Publications] Mitsuru Nenoi: "Interspecific comparison in the frequency of concerted evolution at the pdyubiquitin gene"J.Mol.Evol.. 51. 161-165 (2000)
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[Publications] Hiroadi Abe: "Molecular structure of a novel gypsy-Ty3-like netrotransposon and nested setrotransposable elements"Mol.Gen.Genet.. 268. 916-924 (2000)
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[Publications] Yoonsoo Hahn: "Duplication of genes encoding non-clathrin coat protein gamma- COP in vertebrate insect and plant evolution"FEBS Lett.. 482. 31-36 (2000)
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[Publications] Toshio Uchiumi: "A covalent change of the two highly conserved bases within the GTPase-associated center of ribosomal 28SrRNA in silkworm"J.Biol.Chem.. 273. 35116-35121 (2000)
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[Publications] Guo-Xing Quan: "Isolation and expression of the ecdysteroid- inducible angiotensin- converting enzyme- related gene in wing discs"Insect Mol.Biol.. 31. 97-103 (2001)
