1999 Fiscal Year Annual Research Report

真正細菌SRP RNAのドメイン構造と結合蛋白質、機能・構造相関

Research Project

Project/Area Number	10660072
Research Institution	University of Tsukuba
Principal Investigator	中村幸治筑波大学, 生物科学系, 講師 (40212097)
Keywords	枯草菌 / シグナル認識粒子 / Aluドメイン / ヒストン様蛋白質 / RNA-蛋白質複合体 / 蛋白質分泌 / ドメイン構造 / 2本鎖RNA結合蛋白質
Research Abstract	グラム陽性細菌について、新たに5種類について構造解析を行った結果、調べた全てのSRP RNAには、枯草菌SRP RNAと同様に、ドメインIV構造の他にドメインI,II構造が存在することが明らかとなった。ドメインIV領域にはSRP54の相同因子であるFfhや蛋白質伸張因子EF-Gがそれぞれ独立に結合することを見いだしているが、本研究において、枯草菌SRP RNAドメインI領域に対して高い結合特異性を持つ蛋白質としてヒストン様蛋白質HBsuを同定した。HBsuに対する抗体を用いた免疫沈降実験により、HBsuとEfhはSRP RNAを介して細胞内で複合体を形成していた。また、HBsuの蛋白質分泌系における機能を調べるため、HBsuをIPTGで発現誘導可能な条件欠損異株を作成した。この変異株はIPTG非存在下で培養した結果、培養開始後5〜7時間で顕著な生育阻害を示した。変異株に枯草菌アルカリプロテアーゼ(AprE)、ペニシリン結合蛋白質5^(PBP5^),サイクロデキストリン合成酵素(CGTase)の各種シグナル配列と大腸菌β-lactamase(Bla)との融合蛋白質の発現プラスミドを導入、発現させ、Western blottingにより前駆体の蓄積の解析を行った。HBsu非存在下において培養開始後3時間ですでに、AprE-Bla、PBP5^*-Blaの約50%が前駆体として蓄積しており、CGTase-Blaでは約10%の前駆体の蓄積が観察された。これらの結果よりHBsuはFfh、scRNAと共にSRP様粒子を構成し、一群の蛋白質の分泌に関与していることが示された。

Research Products

(8 results)

All Other

All Publications (8 results)

[Publications] Oguro,A.: "Bacillus subtilis RNase III cleaves both 5'-and 3'-sites of the small cytoplasmic RNA precursor."J Biol Chem.. 273・31. 19542-19547 (1998)
[Publications] Bunai,K.: "Enhancing effect of Bacillus subtilis Ffh, a homologue of the SRP54 subunit of the mammalian signal recognition particle,on the binding of SecA to precursors of secretory proteins in vitro."J Biochem (Tokyo). 125・1. 151-159 (1999)
[Publications] Nakamura,K.: "Depletion of Escherichia coli 4.5S RNA leads to an increase in the amount of protein elongation factor EF-G associated with ribosomes."Eur J Biochem. 259・1-2. 543-550 (1999)
[Publications] Yamazaki,T.: "Depletion of Bacillus subtilis histone-like protein,Hbsu,causes defective protein translocation and induces upregulation of small cytoplasmic RNA"Biochem Biophys Res Commun. 258・1. 211-214 (1999)
[Publications] Nakamura,K.: "Bacillus subtilis histone-like protein,Hbsu,is an integral component of a SRP-like partocle that can bind the Alu domain of small cytoplasmic RNA"J Biol Chem.. 274・19. 13569-13576 (1999)
[Publications] Yamane,K.: "Signal transduction,competence development and protein secretion in Bacillus subtilis"Tanpakushitsu Kakusan Koso. 44・10. 1467-1474 (1999)
[Publications] Suzuma,S.: "Analysisi of Escherichia coli 4.5S RNA binding affinity to Ffh and EF-G."FEMS Microbiol Lett. 180・2. 271-277 (1999)
[Publications] Hirose,I: "Proteome analysis of Bacillus subtilis extracellular proteins: a two-dimensional protein electrophoretic study."Microbiology. 146・1. 65-75 (2000)

1999 Fiscal Year Annual Research Report

真正細菌SRP RNAのドメイン構造と結合蛋白質、機能・構造相関

Principal Investigator

中村 幸治 筑波大学, 生物科学系, 講師 (40212097)

Research Products

[Publications] Oguro,A.: "Bacillus subtilis RNase III cleaves both 5'-and 3'-sites of the small cytoplasmic RNA precursor."J Biol Chem.. 273・31. 19542-19547 (1998)

[Publications] Bunai,K.: "Enhancing effect of Bacillus subtilis Ffh, a homologue of the SRP54 subunit of the mammalian signal recognition particle,on the binding of SecA to precursors of secretory proteins in vitro."J Biochem (Tokyo). 125・1. 151-159 (1999)

[Publications] Nakamura,K.: "Depletion of Escherichia coli 4.5S RNA leads to an increase in the amount of protein elongation factor EF-G associated with ribosomes."Eur J Biochem. 259・1-2. 543-550 (1999)

[Publications] Yamazaki,T.: "Depletion of Bacillus subtilis histone-like protein,Hbsu,causes defective protein translocation and induces upregulation of small cytoplasmic RNA"Biochem Biophys Res Commun. 258・1. 211-214 (1999)

[Publications] Nakamura,K.: "Bacillus subtilis histone-like protein,Hbsu,is an integral component of a SRP-like partocle that can bind the Alu domain of small cytoplasmic RNA"J Biol Chem.. 274・19. 13569-13576 (1999)

[Publications] Yamane,K.: "Signal transduction,competence development and protein secretion in Bacillus subtilis"Tanpakushitsu Kakusan Koso. 44・10. 1467-1474 (1999)

[Publications] Suzuma,S.: "Analysisi of Escherichia coli 4.5S RNA binding affinity to Ffh and EF-G."FEMS Microbiol Lett. 180・2. 271-277 (1999)

[Publications] Hirose,I: "Proteome analysis of Bacillus subtilis extracellular proteins: a two-dimensional protein electrophoretic study."Microbiology. 146・1. 65-75 (2000)

中村幸治筑波大学, 生物科学系, 講師 (40212097)