悪性リンパ腫に特異的な1p36染色体転座に関わる遺伝子の解析

1998 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 10670192
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 佐藤 均 東京大学, 医科学研究所, 助手 (70183829)
• Keywords: 1p36転座 / 悪性リンパ腫 / FISH / コスミド

Research Abstract

悪性リンパ腫の発症に関わる未知の遺伝子を含むと考えられる1p36領域内に21個のコスミド、5個のP1ファージマーカーをマルチカラーFISH法を用いて整列化し細胞遺伝学レベルの物理的地図を構築した。その配列順序は1pter-DIS1002(cYS142)-D1S1053(cYS1467)-D1Z2-D1S1085(cYS1138)一D1S1013(cYS1299)-D1S1032(cYS1384)-D1S1010(cYS1296)/D1S1047(cYS1429)-D1S96-D1S989(cYS1287)/D1S1131(cYS1234)一NPPA-D1S975(cYS1173)-D1S968(cYS1121)-D1S1062(cYS73)-D1S1092(cYS1148)-D1S1130(cYS1232)-D1S1028(cYS1363)-D1S967(cYS1120)-PAX7-D1S1111(cYS1180)-D1S1073(cYS191)-D1S1037(cYS1406)-D1S1112(cYS1181)-D1S1040(cYS144)-D1S112-cen.であった(Satoh et al.,paper in preparation)。
このマップをもとに、SCIDマウス内腫瘍細胞株HMS株の1p36転座切断点を同定した。その切断点はD1S96とD1S989(cYS1287)の間に存在し、ALL由来のB細胞株BALL-1とcytogenetic breakpointが一致した(Satoh et al.,paper in preparation)。そこでHMS株の1p36転座切断点を含むゲノム断片を得るために5'側flanking markerであるD1S96P1ファージマーカーをアンカーとするYACクローンを選別する一方で、3'側flanking markerであるD1S989(cYS1287)コスミドマーカー内のunique sequenceをもとにYAClibraryのスクリーニングを行うために,0.3kb Bom HI断片のシーケンスを行った。このsequenceの5'側30bpはEST AA650088の3'側30bpと100%塩基配列が一致した。
このEST配列内にprimerをセットしmicrocell hybridのゲノムDNAをtemplateにしてPCRを施行した結果、ESTが第一染色体上にマップされることを確認した。現在、隣接するfragmentの同定を行っている。

Research Products

• [Publications] Koh Nakata: "Augmented proliferation of human alveolar macrophages after allogeneic bone marrow transplantation." Blood. 93. 667-673 (1999)
• [Publications] Peter Good: "The human Musashi Homologue 1(HSI1)gene encoding the homologue of Musashi/Nrp1,a neural RNA-binding protein putatively expressed in CNS stem cells and neural progenitor cells." Genomics. 52. 382-384 (1998)
• [Publications] K.Chida: "Assignment of protein kinase Ch(Pkch)to mouse chromosome band 12qC3-D2 by in situ hybridization." Cytogenet Cell Genet. 82. 30-31 (1998)
• [Publications] K.W.Cho: "The cat immunoglobulin lambda light chain gene maps to chromosome D3p12-p11." Mamm Genome. 9. 178-179 (1998)
• [Publications] K.W.Cho: "Cloning and mapping of cat(Felis catus)immunoglobulin and T-cell receptor genes." Immunogenetics. 47. 226-233 (1998)