1998 Fiscal Year Annual Research Report
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10670222
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| Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
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Principal Investigator |
阿部 賢治 国立感染症研究所, 感染病理部, 主任研究官 (60130415)
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| Keywords | G型肝炎 / G型肝炎ウイルス(HGV)遺伝子 / HGVゲノタイプ / 分子系統樹解析 |
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| Research Abstract |
【目的】G型肝炎ウイルス(HGV)の全長ウイルスをクローニングし、その分子ウイルス学的特徴を明らかにすることを目的とした。更に、分離株の変異速度を求めた。
【患者】HBV,HCV,HGVの持続感染を認める日本人肝硬変患者を対象とした。さらに、現在と12年前の血清からHGVを分離し比較検討した。【方法】血清100ulよりRNAを抽出しnestedRT-PCR法によりHGVの各領域を増幅後、サブクローニング法にて塩基配列を決定した。5UTRおよび3UTR領域はRACE法にて増幅した。分離株はGenBankより入手した既知のHGVを含めて、分子系統樹解析を行った。
【結果】全長9387ntよりなるHGV(HGV-IM71)を分離した。HGV-IM71は2873個のアミノ酸をコードするpolyproteinと、458ntと310ntよりなる5UTRと3UTR各々有していた。3UTRには、poly-Aの存在は認められなかった。既知のGBV-C/HGV株を比較すると、塩基レベルで西アフリカ株(GBV-C)とは81.1%、米国株(HGV-PNF2161)とは85.1%、日本株(GT230)とは86.5%の相同性を有していた。分子系統樹解析では大きく三群に大別でき、HGV-IM71はアジア型に分類できた。更に同一患者から12年前に分離された約6Kbの遺伝子との比較から、その変異速度は0.8×10^<-3>/site/yearと推定された。【結語】日本人由来のHGV全長遺伝子を分離した。HGV-IM71は既知のHGV/GBV-C株とは高い相同性を有していた。一般のRNAウイルスと同様に時間の推移による遺伝子変異を認めたが、HCVにみられる高変異領域を示唆する所見は得られなかった。
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Research Products
(6 results)
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[Publications] 阿部 賢治: "Geographical characterization of hepatitis G virus genome: evidence for HGV genotypes based on phylogenetic analysis." Hepatology Research. 10. 121-130 (1998)
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[Publications] 阿部 賢治: "Further study of hepatitis C virus RNA detection in formalin-fixed,paraffin-embedded liver tissues by ligation-dependent polymerase chain reaction." Pathology International. 48. 428-432 (1998)
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[Publications] 阿部 賢治: "In situ detection of hepatitis B,C and G virus nucleic acids in human hepatocellular carcinoma tissues from different geographic regions." Hepatology. 28. 568-572 (1998)
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[Publications] 阿部 賢治: "Hepatitis C virus RNA in dried serum spotted onto filter paper is stable at room temperature." Journal of Clinical Microbiology. 36. 3070-3072 (1998)
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[Publications] 阿部 賢治: "Molecular cloning of full-length sequence of hepatitis G virus genome isolated from a Japanese patient with chronic liver disease." Hepatology Research. 12. 207-216 (1998)
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[Publications] 阿部 賢治: "Prevalence of hepatitis G virus and characterization of viral genome in Ghana." Hepatology Research. 13. 221-231 (1999)
