1999 Fiscal Year Annual Research Report
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10670222
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| Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
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Principal Investigator |
阿部 賢治 国立感染症研究所, 感染病理部, 主任研究官 (60130415)
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| Keywords | G型肝炎 / G型肝炎ウイルスゲノム / HGVゲノタイプ / HGV4型 / ミャンマー / ベトナム / 分子疫学 / 分子系統樹解析 |
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| Research Abstract |
G型肝炎ウイルス(HGV)の分子疫学調査から、ミャンマー、ベトナムにおいて、従来のゲノタイプ分類には属さない新しいHGV株を分離することができたので、その分子生物学的特徴を解析した。検体および方法は、5'UTR領域の塩基配列解析から、新たなゲノタイプに属すミャンマー人由来株(HGV-MY14)およびベトナム人由来株(HGV-VT48)を対象とした。塩基配列は、サブクローニング法にて決定した。また得られた塩基配列をもとに木村の8パラメーター法で遺伝的距離を確定し、近隣接合法を用いて分子系統樹解析を実施した。その結果、5'UTRの終末部を除くほぼ全長HGV遣伝子を2株分離することができた。両者共に9228ntよりなり、2842個のアミノ酸をコードするpolyproteinを有していた。また2株共16aaからなる短いコア領域を有していた。3'UTRはHGV-MY14は313nt、HGV-VT48は315ntからなり、末端にはいずれもpoly Aは存在しなかった。HGV-MY14とHGV-VT48の全長塩基レベルでの相同率は86%、アミノ酸レベルでは96%であった。4型株の既知のHGV株(1〜3型)に対する塩基の相同率は78〜84%、アミノ酸レベルでは92〜93%であったが、3型株に対してより高い相同性を示した。また既知のHGV株28株を加えた全長遺伝子領域における分子系統樹解析においてもHGV-MY14およびHGV-VT48は従来の分類には属さず、新たな分類(4型)であることが確認された。さらに4型株はミャンマーとベトナムにおいてのみ、その存在が確認された。以上の成績は、自然界におけるHGVの生態、ウイルスの起源、民族疫学、感染経路などを知る上で興味深い。
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Research Products
(6 results)
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[Publications] 阿部賢治: "Prevalence of hepatitis G virus and characterization of viral genome in Ghana"Hepatology Research. 13. 221-231 (1999)
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[Publications] 阿部賢治: "Identification of a novel genotype of hepatitis G virus in Southeast Asia"Journal of Clinical Microbiology. 37. 1217-1220 (1999)
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[Publications] 阿部賢治: "TT virus infection is widespread in the general populations from different geographic regions"Journal of Clinical Microbiology. 37. 2703-2705 (1999)
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[Publications] 阿部賢治: "Epidemiology of hepatitis B,C,E and G virus infection and molecular analysis of hepatitis G virus isolates in Bolivia"Journal of Clinical Microbiology. 37. 3291-3295 (1999)
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[Publications] 阿部賢治: "The entire nucleotide sequence of two hepatitis G virus isolates belonging to a novel genotype : Isolation in Myanmar and Vietnam"Journal of General Virology. 81. 189-194 (2000)
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[Publications] 阿部賢治: "TT virus infection in nonhuman primates and characterization of the viral genome : Identification of simian TT virus isolates"Journal of Virology. 74. 1549-1553 (2000)
