2000 Fiscal Year Annual Research Report
Machado-Joseph病遺伝子ゲノムの全塩基配列の決定
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10670577
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
後藤 順 東京大学, 医学部・附属病院, 助手 (10211252)
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| Keywords | Machado-Joseph病 / トリプレット・リピート病 / 14番染色 / ゲノム / 塩基配列 / 一塩基置換多型(SNP) |
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| Research Abstract |
Machado-Joseph病(MJD)は進行性の神経変性疾患で、小脳性運動失調および種々の随伴症状を呈する。本症は常染色体性優性遺伝形式をとる遺伝性疾患で、原因遺伝子MJDは14q32.1に位置し、翻訳領域内のCAGリピートの異常伸長によって発症する。CAGリピートに対応するポリグルタミンの異常伸長が発病機序に密接に関与していることが明らかにされているが、MJD遺伝子の生理的機能、ゲノム構造、発現については十分に明らかにされていなかった。本研究は大規模シークエンシングなどにより、MJD遺伝子のゲノム構造、プロモーター領域,発現を明らかにすることを目的とした。27箇のcDNAクローン、13箇のコスミッドと8箇のBACクローンを得、解析を行った。FISH法によりMJD遺伝子を含む約300kbのゲノム・コンティグを作成した。内175kbの全塩基配列を決定し、MJD遺伝子は11箇のエクソンからなる約48.2kbの遺伝子で、3'端の2箇のエクソンは選択的スプライシングにより使い分けられている。また複数のポリA付加部位が存在し、少なくとも約1.4、1.9、2.0、4.4、7.0kbの転写産物が予測された。ノーザンブロットにてこれらにほぼ対応する転写産物が確認された。これらの結果について論文投稿中である。CAPクローンおよび独立した複数のcDNAクローンより転写開始点は翻訳開始点より58塩基上流と推定される。プロモーター領域にTATAボックスCCAATは存在しないが、4箇所のGCボックス、Sp1、USF、SRY結合配列が認められる。翻訳領域内にアミノ酸置換を伴う一塩基置換多型(SNP)を2箇所、伴わないSNPを1箇所同定した。これらの多型について日本人一般集団及びMJD患者について検討したところ2種のハプロタイプが同定され、CAGリピート長並びに罹患染色体各々と間に強い連鎖不平衡が認められた。
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[Publications] Shimohata T,Nakajima T,Yamada M, et al.: "Expanded polyglutamine stretches interact with TAF_<II>130, interfering with CREB-dependent transcription."Nature Genetics. 26(1). 29-36 (2000)
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[Publications] Hazeki N,Tukamoto T,Goto J,Kanazawa I: "Formic Acid Dissolves Aggregates of an N-Terminal Huntingtin Fragment Containing an Expanded Polyglutamine Tract : Applying to Quantification of Protein Components of the Aggregates."Biochemical and Biophysical Research Communications. 277(2). 386-393 (2000)
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[Publications] Gaspar C,Lopes-Cendes I,Hayes S,Goto J, et al.: "Ancestral Origins of the Machado-Joseph Disease Mutation : A Worldwide Haplotype Study."The American Journal of Human Genetics. 68(2). 523-528 (2001)
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[Publications] 後藤順: "脊髄小脳変性症の診断基準・病型分類・重症度."内科. 85(6). 1544-1547 (2000)
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[Publications] 後藤順: "Machado-Joseph病."内科. 85(6). 1599 (2000)
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[Publications] 後藤順: "歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症(DRPLA)."内科. 85(6). 1600 (2000)
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[Publications] 市川弥生子,後藤順: "関東地方における遺伝性脊髄小脳変性症の特異性."神経内科. 53. 104-110 (2000)
