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2011 Fiscal Year Annual Research Report

生細胞内のRNAポリメラーゼII動態の計測

Research Project

Project/Area Number 10F00712
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

木村 宏  大阪大学, 生命機能研究科, 准教授

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) STASEVICH Timothy  大阪大学, 生命機能研究科, 外国人特別研究員
Keywords転写制御 / RNAポリメラーゼ / 細胞核 / 翻訳後修飾 / エピジェネティクス / 遺伝子発現 / 生細胞イメージング
Research Abstract

真核生物のRNAポリメラーゼIIは、遺伝子の転写を担う重要な酵素であり、十数個のサブユニットから構成される。生きた細胞の中で、RNAポリメラーゼがどのように転写開始、伸長、終結を行うのかを明らかにすることは、遺伝子発現制御を理解するうえで非常に重要である。これまでにもGFP融合蛋白質を用いてRNAポリメラーゼIIの生細胞における分子動態が解析されてきたが、個々の報告で異なるモデルと結果が得られておりその全容の解明には至っていない。本研究は、RNAポリメラーゼIIの状態に応じて付加される翻訳後修飾の違いを利用して、そのプロモータ上へのリクルート、転写開始、転写伸長の各ステップに至るキネティクスを明らかにするとともに、ヒストン修飾などクロマチン構造の変化と転写制御の関係を生きた細胞で明らかにすることを目的として行った。昨年度の研究で、Fabを用いた内在性RNAポリメラーゼII検出系を構築し、転写誘導に伴うRNAポリメラーゼIIの動態を計測した。本年度は、その計測結果の定量化を行った。また、ヒストンH3K27のアセチル化の変動も合わせて解析を行った。さらに、定量的ウェスタンブロッティングにより、細胞あたりのRNAポリメラーゼIIの総量と特定のリン酸化状態にある分子数を見積もった。そして、RNAポリメラーゼIIの集積、転写開始、転写伸長のキネティックモデルの構築とシミュレーションを行い、RNAポリメラーゼIIの数と生細胞計測により得られた集積曲線に最もよく適合する数値を導き出した。その結果、遺伝子のプロモータにリクルートされたRNAポリメラーゼIIが、転写開始に至るまでに、複数回の解離と結合を繰り返すこと、また、転写開始から伸長に至る過程は比較的効率が高いこと、また、ヒストンの脱アセチル化が新規転写を抑制する可能性があることなどが示唆された。

  • Research Products

    (7 results)

All 2012 2011 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Tracking epigenetic histone modifications in single cells using Fab-based live endogenous modification labeling2011

    • Author(s)
      Yoko Hayashi-Takanaka
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 39 Pages: 6475-6488

    • DOI

      10.1093/nar/gkr343

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Assembly of the transcription machinery : ordered and stable, random and dynamic, or both?2011

    • Author(s)
      Timothy J.Stasevich
    • Journal Title

      Chromosoma

      Volume: 120 Pages: 533-545

    • DOI

      10.1007/s00412-011-0340-y

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Visualizing live-cell epigenetic modifications of endogenous RNA polymerase II and histones at an activated gene array2012

    • Author(s)
      Timothy J Stasevich
    • Organizer
      Visualizing the transcription cycle of endogenous RNA polymerase II in single living cells
    • Place of Presentation
      San Diego Convention Center (San Diego、アメリカ)
    • Year and Date
      2012-02-27
  • [Presentation] Visualizing the Transcription Cycle of RNA Polymerase II in Single Living Cells2011

    • Author(s)
      Timothy J Stasevich
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-12-16
  • [Presentation] 蛋白質翻訳後修飾の生細胞イメージング2011

    • Author(s)
      木村宏
    • Organizer
      第11回蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      ホテル阪急エキスポパーク(大阪府吹田市)(招待講演)
    • Year and Date
      2011-06-08
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.dma.jim.osaka-u.ac.jp/kg-portal/aspi/RX0011D.asp?UNO=17710&page=

  • [Remarks]

    • URL

      http://www.fbs.osaka-u.ac.jp/labs/hiraoka/index.html

URL: 

Published: 2013-06-26   Modified: 2013-07-01  

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