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2012 Fiscal Year Annual Research Report

前立腺癌のゲノムワイド関連解析

Research Project

Project/Area Number 10J02102
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

赤松 秀輔  京都大学, 医学研究科, 特別研究員(DC1)

Keywords遺伝子多型 / 癌罹患 / 前立腺癌
Research Abstract

当該年度においては、まず、GWASにおいて日本人の前立腺癌罹患との関連が確認された16の単塩基多型を用いて日本人の前立腺癌患者689人、対照群749人の情報を基にロジスティック回帰分析による罹患リスクモデルを構築した。次に、モデルの再現性を全く独立した2つの日本人サンプル(前立腺癌患者3,294人、対照群6,281人)を用いて確認した。その結果、リスクモデルを構築したサンプル群におけるモデルの曲線下面積(AUC)は0.679、再現性評価に用いた2群におけるAUCは0.655,0.661であり、高い再現性が確認された。さらに、カルフォルニアおよびハワイに在住する日系人サンプルにおいても高い再現性が認められた。次に、罹患リスクモデルとPSAの関連の有無について検討した。PSA1-10ng/mlのサンプルに限定した場合においてもAUCはほぼ同等であり、リスクスコアとPSAの間にも相関は認められず、リスクモデルがPSAとは独立した指標であることが確認された。最後に、PSAグレーゾーンにおいて罹患リスクモデルを適用した場合の検査後確率についてシミュレーションを行い、罹患リスクモデルの臨床における有用性について検討した。リスクモデルによって24.2%のサンプルが低リスク(オッズ<0.5)、9.7%のサンプルが高リスク(オッズ>2.0)と分類された。PSAグレーゾーンにおける前立腺癌診断率を20%と想定した場合にリスクモデルを適用すると低リスク、高リスク群における検査後確率はそれぞれ10.7%,42.4%であり、臨床において有用な指標になる可能性が示唆された。
本研究において単塩基多型に基づく前立腺癌罹患リスクモデルは高い再現性を示し、PSAと完全に独立した指標であった。PSAグレーゾーンにおいて適用することで、高リスク群は即時前立腺生検、低リスク群はPSA経過観察するといった臨床判断に影響を与えうる指標であることが確認された。今後、実臨床現場においての精度、再現性、有用性の確認が待たれる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当該年度においては、これまでのGWASにおける研究成果を臨床現場に還元すべく、GWASで得られたデータに基づき前立腺癌の罹患リスクモデルを構築し、その再現性や精度、臨床における有用性の評価等に関する研究が行われた。その結果、構築されたリスクモデルが、現在、臨床上課題となっている、PSAグレーゾーンにおいてPSAと独立した指標としてPSAを補完しうることが確認され、研究成果をPlos One誌に報告できたため。

Strategy for Future Research Activity

今後は、今回のデータを基に、先進医療申請を含めて臨床現場での応用を準備していく予定である。

  • Research Products

    (5 results)

All 2012 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Reproducibility, performance, and clinical utility of a genetic risk prediction model for prostate cancer in Japanese.2012

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Journal Title

      Plos One

      Volume: 7

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0046454.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 前立腺癌のゲノムワイド関連解析2012

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Organizer
      第71回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      札幌(招待講演)
    • Year and Date
      2012-09-21
  • [Presentation] Reproducibility, performance, and clinical utility of a genetic risk prediction model for prostate cancer in Japanese patients.2012

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Organizer
      2012 American Society of Clinical Oncology Annual Meeting
    • Place of Presentation
      米国シカゴ
    • Year and Date
      2012-06-04
  • [Presentation] 日本人における前立腺癌罹患関連領域として11q12, 10q26, 3p11.2,および2p11領域が新規に同定された。2012

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Organizer
      第100回日本泌尿器科学会総会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2012-04-21
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.riken.go.jp/pr/press/20121011/

URL: 

Published: 2014-07-16  

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