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2010 Fiscal Year Annual Research Report

シアノバクテリア光化学系II複合体に関する構造生物学的研究

Research Project

Project/Area Number 10J02491
Research InstitutionOsaka City University

Principal Investigator

川上 恵典  大阪市立大学, 大学院・理学研究科, 特別研究員(PD)

Keywords光化学系II
Research Abstract

光化学系II複合体(PSII)は、太陽の光エネルギーを生物が利用可能な化学エネルギーに変換すると共に、水を分解して酸素を発生させる超分子複合体である。PSIIの結晶構造はこれまで3.8~2.9Å分解能で報告されていたが、酸素発生反応を直接触媒しているMn_4Caクラスターとその周辺構造は、低分解能のため解明出来ていなかった。さらに、PSIIが酸素発生反応を行うためには塩素イオンが不可欠であることが以前から報告されているが、酸素発生反応における塩素イオンの機能的役割と、同族元素であるヨウ素イオンに置換することによって起こる酸素発生活性の失活の原因は未だ不明である。申請者はこれまでPSIIの精製・結晶化に従事し、PSII標品の精製・結晶化条件の最適化を行うことで、1.9Å分解能のX線回折強度データを収集することに成功し、このデータを共同研究者である梅名泰史博士研究員に解析して頂き、世界で初めてPSIIの酸素発生中心とその周辺構造を原子レベルで解明することに成功した。そして、この精製・結晶化条件を用いて、PSII内に存在する塩素イオンを臭素及びヨウ素イオンに置換した結晶を作製し、各結晶を2.0~2.1Å分解能という高い精度のX線回折強度データを収集することに成功した。これらの構造解析の現状は、まず各データの異常分散図から、塩素イオンが存在する位置(Cl-1, Cl-2 site)に臭素またはヨウ素イオンが付加されていることを確認した。さらに、臭素置換体PSII結晶における2つの臭素イオンの存在位置はそれぞれの塩素イオンの位置とほぼ同じであったのに対し、2つのヨウ素イオンの存在位置はそれぞれの塩素イオンの位置と少し異なっており、特にCl-2 siteに存在するヨウ素イオン周辺のアミノ酸残基に構造変化が起こっている兆候が、現在精密化中の電子密度図から見られた。今後、得られた各データの構造精密化を進めていくことで、ヨウ素置換によって起こる酸素発生反応の失活のメカニズムを解明する。

  • Research Products

    (13 results)

All 2011 2010 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (6 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Purification and crystallization of oxygen-evolving photosystem II core complex from thermophilic cyanobacteria2011

    • Author(s)
      J.-R.Shen, K.Kawakami, H.Koike
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 684 Pages: 41-51

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Photosynthetic oxygen evolution in mesoporous silica material : adsorption of photosystem II reaction center complex into 23nm nanopores in SBA2011

    • Author(s)
      T.Noji, C.Kamidaki, K.Kawakami, J.-R.Shen, T.Kajino, Y.Fukushima, T.Sekitoh, S.Itoh
    • Journal Title

      Langmuir

      Volume: 27 Pages: 705-713

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Roles of PsbI and PsbM in photosystem II dimer formation and stability studied by deletion mutagenesis and X-ray crystallography2011

    • Author(s)
      K.Kawakami, Y.Umena, M.Iwai, Y.Kawabata, M.Ikeuchi, N.Kamiya, J.-R.Shen
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta.

      Volume: 1807 Pages: 319-325

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystal structure of oxygen-evolving photosystem II at a resolution of 1.9Å *These authors contributed equally to this work.2011

    • Author(s)
      Y.Umena, K.Kawakami, J.-R.Shen, N.Kamiya
    • Journal Title

      Nature

      Volume: (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structure of the catalytic, inorganic core of oxygen-evolving photosystem II at 1.9Å resolution2011

    • Author(s)
      K.Kawakami, Y.Umena, N.Kamiya, J.-R.Shen
    • Journal Title

      J Photochem Photobiol B

      Volume: (in press)

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Labile electronic and spin states of the CaMn4O5 cluster in the PSII system refined to the 1.9Å X-ray resolution. UB3LYP computational results2011

    • Author(s)
      K.Kanda, S.Yamanaka, T.Saito, Y.Umena, K.Kawakami, J.-R.Shen, N.Kamiya, M.Okurura, H.Nakamura, K.Yamaguchi
    • Journal Title

      Chemical Physics Letter.

      Volume: 506 Pages: 98-103

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Characteristics of channels and arrangement of cofactors in the 1.9 angstrom resolution structure of photosystem II2011

    • Author(s)
      川上恵典・梅名泰史・神谷信夫・沈建仁
    • Organizer
      第52回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      仙台,東北大学川内北キャンパス
    • Year and Date
      20110320-20110322
  • [Presentation] 1.9Å分解能における光化学系II複合体内の色素配置2011

    • Author(s)
      川上恵典・梅名泰史・神谷信夫・沈建仁
    • Organizer
      大阪大学蛋白質研究所セミナー「分子科学と生理学が解き明かす植物の光エネルギー変換の新展開」
    • Place of Presentation
      大阪,大阪大学蛋白質研究所
    • Year and Date
      20110309-20110310
  • [Presentation] 酸素発生光化学系II複合体の1.9 A分解能におけるX線結晶構造解析2011

    • Author(s)
      神谷信夫・梅名泰史・川上恵典・沈建仁
    • Organizer
      第24回日本放射光学会年会
    • Place of Presentation
      筑波,つくば国際会議場
    • Year and Date
      20110107-20110110
  • [Presentation] 光化学系II複合体結晶の分解能向上2010

    • Author(s)
      川上恵典・梅名泰史・田代隆慶・神谷信夫・沈建仁
    • Organizer
      第60回日本結晶学会年会
    • Place of Presentation
      大阪,大阪大学コンベンションセンター
    • Year and Date
      20101203-20101205
  • [Presentation] Improvement of the quality of photosystem II crystals for its structural analysis at an atomic resolution2010

    • Author(s)
      K.Kawakami, Y.Umena, T.Tashiro, N.Kamiya, J.-R.Shen
    • Organizer
      15th International Congress of Photosynthesis
    • Place of Presentation
      Beijing, China
    • Year and Date
      20100822-20100827
  • [Presentation] 光化学系II複合体結晶の分解能向上2010

    • Author(s)
      川上恵典・梅名泰史・田代隆慶・神谷信夫・沈建仁
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      北海道,札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      20100616-20100618
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.Osaka-cu.ac.jp/news/20110418110425/research.html

URL: 

Published: 2012-07-19  

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