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2010 Fiscal Year Annual Research Report

低酸素下遺伝子誘導においてヒストン修飾が果たす役割の解明

Research Project

Project/Area Number 10J02514
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

三村 維真理  東京大学, 医学部附属病院, 特別研究員(DC2)

Keywords低酸素 / HIF / ヒストン修飾酵素 / JMJD1a
Research Abstract

申請者は低酸素下においてHIF1が結合することにより発現制御されるヒストン脱メチル化酵素の一つであるJMJD1a(jumonji-domain containing 1a)に着目した。ヒト臍帯静脈血管内皮細胞(HUVEC : human umbilical vascular endothelial cells)を正常酸素分圧および低酸素分圧で培養し、JMJD1aをsiRNAによりノックダウンしたときのDNA microarray、およびJMJD1aをアデノウイルスにより過剰発現させたときのDNA microarrayを行った。その結果、JMJD1aをノックダウンすると低酸素刺激をかけても発現が上昇しなくなる遺伝子群、JMJD1aを過剰発現した上で低酸素刺激をかけると発現がさらに上昇する遺伝子群を同定した。両者に共通してみられた遺伝子群は22遺伝子あり、低酸素刺激下でJMJD1a依存的に発現が制御される遺伝子群すなわちJMJD1aの下流遺伝子群(ターゲット遺伝子群)と考えられた。また、そのうち12遺伝子は低酸素下におけるHIF1のターゲット遺伝子であることから、HIF1およびJMJD1aともに発現制御を受けていると考えられた。さらに、HIF1のノックダウンを行ったうえで低酸素をかけた時のDNA microarrayと比較すると、さらにHIF1およびJMJD1aの下流遺伝子を同定した。
これまでの報告によりJMJD1aはヒストン3(H3)リジン残基9番目(K9)のmono-methyl((me1),di-methy1(me2)を脱メチル化することが知られている。そこで、上記で同定したJMJD1aのターゲット遺伝子上で、これらのヒストン修飾状態が低酸素刺激によりどのように変化するかを調べた。申請者はJMJD1aのターゲット遺伝子候補の一つであるSLC2A3に着目し、H3K9me2抗体を用いてヒストン修飾変化をCHIP-PCRで同定した。SLC2A3の転写開始点(TSS : transcriptional starting sites)と上流35kbのenhancerにおけるH3K9me2レベルは低酸素刺激下において低下することが分かった。このことから、JMJD1aはSLC2A3のTSSおよびenhancer領域において、H3K9me2を脱メチル化し、発現制御する新たなメカニズムを解明することに成功した。現在はJMJD1a抗体を用いたクロマチン免疫沈降)を行い、JMJD1aが機能する部位を全網羅的に解析することを行っている。

  • Research Products

    (12 results)

All 2011 2010

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Malnutrition and inflammation determine prognosis of patients with CRS type42011

    • Author(s)
      Imari Mimura, Hiroshi Nishi, Takahiro Nishi, Naobumi Mise, Tokuichiro Sugimoto.
    • Journal Title

      Blood Purification

      Volume: 31 Pages: 276-280

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Pathophysiological Response to Hypoxia-From the Molecular Mechanisms of Malady to Drug Discovery : Epigenetic Regulation of the Hypoxic Response via Hypoxia-Inducible Factor and Histone Modifying Enzymes.2011

    • Author(s)
      Imari Mimura, Tetsuhiro Tanaka, Youichiro Wada, Tatsuhiko Kodama, Masaomi Nangaku
    • Journal Title

      Journal of Pharmacological Science

      Volume: 115 Pages: 453-458

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cytoglobin, a novel member of the globin family, protects kidney fibroblasts against oxidative stress under ischemic conditions.2011

    • Author(s)
      Hiroshi Nishi, Reiko Inagi, Norifumi Kawada, Katsutoshi Yoshizato, Imari Mimura, Toshiro Fujita, Masaomi Nangaku
    • Journal Title

      American journal of Pathology

      Volume: 178 Pages: 128-139

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The suffocating kidney : Tubulointerstitial hypoxia in end-stage kidney disease.2010

    • Author(s)
      Imari Mimura, Masaomi Nangaku.
    • Journal Title

      Nature Review Nephrology

      Volume: 6 Pages: 667-678

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cytoglobin, a novel globin, plays an anti-fibrotic role in the kidney.2010

    • Author(s)
      Imari Mimura, Masaomi Nangaku, Hiroshi Nishi, Reiko Inagi, Tetsuhiro Tanaka, Toshiro Fujita
    • Journal Title

      American journal of Physiology-Renal Physiology

      Volume: 299 Pages: F1120-F1133

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Left ventricular geometry and cardiovascular mortality based on haemodialysis patient autopsy analyses.2010

    • Author(s)
      Imari Mimura, Hiroshi Nishi, Naobumi Mise, Masaya Mori, Tokuichiro Sugimoto.
    • Journal Title

      Nephrology

      Volume: 15 Pages: 549-554

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Epigenetic regulation of GLUT3 via HIF1 as an enhancer under hypoxia.2011

    • Author(s)
      三村維真理、和田洋一郎、堤修一、神吉康晴、井上剛、油谷浩幸、南学正臣、児玉龍彦
    • Organizer
      CDB Synposium 2011
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2011-03-14
  • [Presentation] 低酸素血管内皮細胞における転写因子HIFの網羅解析2010

    • Author(s)
      三村維真理、南学正臣、井上剛、和田洋一郎、堤修一、油谷浩幸、児玉龍彦、藤田敏郎
    • Organizer
      第5回高血圧と冠動脈疾患研究会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2010-12-25
  • [Presentation] 低酸素下における転写因子HIFの血管内皮細胞での結合部位に関する網羅的解析2010

    • Author(s)
      三村維真理、井上剛、和田洋一郎、堤修一、油谷浩幸、児玉龍彦、藤田敏郎、南学正臣
    • Organizer
      第1回腎不全研究会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2010-12-11
  • [Presentation] Elucidation of the anti-fibrotic mechanism of a novel HIF-regulated globin, cytoglobin, with molecular genetics2010

    • Author(s)
      Imari Mimura, Hiroshi Nishi, Tetsuhiro Tanaka, Reiko Inagi, Toshiro Fujita, Masaomi Nangaku
    • Organizer
      American Society of Nephrology 2010
    • Place of Presentation
      Denver, USA
    • Year and Date
      2010-11-19
  • [Presentation] 低酸素下における転写因子HIF1のHUVEC結合部位に関する網羅的解析2010

    • Author(s)
      三村維真理、和田洋一郎、堤修一、油谷浩幸、児玉龍彦、南学正臣、藤田敏郎
    • Organizer
      第53回日本腎臓学会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場
    • Year and Date
      2010-06-17
  • [Presentation] Epigenetic regulation of GLUT3 via HIF1 as an enhancer under hypoxia.2010

    • Author(s)
      Imari Mimura, Tsuyoshi Inoue, Youichiro Wada, Shuichi Tsutsumi, Hiroyuki Aburatani, Toshiro Fujita, Tatsuhiko Kodama, Masaomi Nangaku.
    • Organizer
      ISN NEXUS Kyoto
    • Place of Presentation
      京都国際会議場
    • Year and Date
      2010-04-16

URL: 

Published: 2012-07-19  

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