水晶発振子を用いるバイオターゲッティングの定量的評価

1999 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 11132215
• Research Institution: Tokyo Institute of Technology
• Principal Investigator: 岡畑 恵雄 東京工業大学, 生命理工学部, 教授 (80038017)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 森 俊明 東京工業大学, 生命理工学部, 助手 (50262308) ; 佐藤 智典 東京工業大学, 生命理工学部, 助教授 (00162454)
• Keywords: 水晶発振子 / DNA二本鎖 / 分子認識 / bZIPペプチド / ポリメラーゼ

Research Abstract

本研究は、マイクロバランスとして知られる水晶発振子上にDNAを固定化し、ポリメラーゼや転写因子などのたんぱく質がDNA鎖の塩基配列を認識して結合する過程を振動数変化から定量することを目的として行い、以下の成果を得た。
水晶発振子の表面に50bpのDNA二本鎖を固定化し、bZIPペプチドがATTC鎖を特異的に認識して結合し、その結合定数は10^8M^<-1>と大変大きいことを明らかにした。さらにポリメラーゼが二本鎖に結合してDNA鎖を重合していく過程も追跡できた。

Research Products

• [Publications] K. Niikura, H. Matsuno, and Y. Okahata: "Binding Behaviors of Lysine-containing Helical Peptides to DNA Duplexes immobilized on a 27 MHz Quartz-Crystal Microbalance"Chem. Eur. J.. 5. 1609-1616 (1999)
• [Publications] Y. Okahata, Y. Masunaga, H. Matsuno, and H. Furusawa: "Quantitative detection of a DNA ligase reaction on a quartz-crystal microbalance"Nucleic Acids Symposium Ser.. 42. 147-148 (1999)