1999 Fiscal Year Annual Research Report
リボソーム蛋白質-RNA複合体の相互作用機構の解析
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11169228
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
木村 誠 九州大学, 農学部, 助教授 (10204992)
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| Keywords | リボソームタンパク質 / 高次構造 / タンパク質-RNA相互作用 / リボソームRNA |
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| Research Abstract |
中度好熱菌Bacillus stearothermophilusリボソームタンパク質、特にリボソームRNA結合タンパク質(5SrRNA結合タンパク質:L5、L18;16SrRNA結合タンパク質:S4、S7;23SrRNA結合タンパク質:L2、L3、L4、L23)に着目し、これらの遺伝子のクローニングと大腸菌内での発現、さらにタンパク質S7、L2(RNA結合ドメイン)およびL5の結晶構造解析を終了した。以上の研究成果より、リボソームタンパク質S7は、細菌DNA結合タンパク質HUと、L2は真核生物のオリゴヌクレオチド結合タンパク質と、さらに、L5はスプライセオゾームを形成するU1タンパク質と、高次構造の相同性を持つことが明かになった。これらの類似性については、各タンパク質のアミノ酸配列の比較では明かではなかったことで、これらの高次構造より判明した事実は、各リボソームタンパク質と各相同タンパクは、共通の祖先型遺伝子から派生していることを示唆した。また、S7の16SrRNAとの相互作用に関与するアミノ酸残基を、遺伝子工学的手法を用いて特定し、S7と16SrRNAとの相互作用機構のモデルを提唱した。
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[Publications] Nakagawa 等: "The-thtee-dimensional structure of the RNA-binding domain of ribosomal protein LZ;a protein at the pepticlyl transferase center of theribosome"The EMBO Journal. 18・6. 1459-1467 (1999)
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[Publications] Miyamoto 等: "Role of the N-terminal region of ribosomal protein S7 in its interaction with 16S rRNA which binds to the concavity formed by the β-ribbon arm and the α-hel"Eur.J.Biochem.. 266. 591-598 (1999)
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[Publications] Saitoh 等: "Arginine-55 in the β-arm is essential for the activity of DNA binding protein HU from Bacillus stearothermophilus"Biosci.Biotechnol.Biochem.. 63-12. 2232-2235 (1999)
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[Publications] Nakagawa 等: "Crystal structure of a ribonuclease From the seeds of bitter gourd at 1.75A"Biochim.Biophysi.Acta. 1433. 253-260 (1999)
