2000 Fiscal Year Annual Research Report
リボソーム蛋白質-RNA複合体の相互作用機構の解析
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11169228
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| Research Institution | Kyushu University |
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Principal Investigator |
木村 誠 九州大学, 農学研究院, 助教授 (10204992)
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| Keywords | リボソーム蛋白質 / RNA / 蛋白質-RNA 相互作用 / 高次構造 / X線解析 |
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| Research Abstract |
中度耐熱菌(Bacillus stearothermophilus)の5S rRNA結合タンパク質L5(BstL5)の結晶構造を決定するとともに、5S rRNAとの相互作用に関与するアミノ酸残基を特定した。BstL5はαβαββαββαの二次構造からなり、スプライセオソームを構成するU1Aタンパク質等に見い出されたRNA結合モチーフ(RNPモチーフ:αββαββ)を持つことが明らかになった。次に、U1Aタンパク質とRNAとの相互作用に関する情報に基づいて、BstL5のループとβ-シートに存在するアミノ酸(Asn37,Glu63,Phe77,Arg80,Thr90,Ile141,Tyr143,Asp144,Asp153)の5S rRNA結合活性への関与について検討した。その結果、β-シートのAsn37,Glu63、ループのPhe77が5S rRNAとの相互作用に強い影響力を示していること、さらにP-シートに存在するThr-90、ループに位置するIle141,Tyr143,Asp144も相互作用に弱冠ながら関与していること、β-シートのAsp153,ループのArg80は5S rRNAとの結合活性には全く関与していないことが解った。以上の結果より、タンパク質L5はタンパク質U1Aとはアミノ酸配列は異なるが、両タンパク質は同様の機構で、それぞれの標的RNAと相互作用していることが示唆された。
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[Publications] Numata 等: "Expression and mutational analysis of amino acid residues involved in catalytic activity in a ribonuclease"Biosci.Biotechnol.Biochem.. 64・3. 603-605 (2000)
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[Publications] Kouzuma 等: "Molecular cloning and functional expression of cDNA encoding the cycteine proteinase inhibitor"J.Biochem.. 128. 161-166 (2000)
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[Publications] Suzuki 等: "Cystal structure of ribonuclease MCl from bitter gourd seeds complexed with 1'-UMP"Biochem.Biophys.Res.Commun.. 275. 572-576 (2000)
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[Publications] Numata 等: "Amino acid residues in ribonuclease MCl from bitter gourd seeds which are essential"Biochemistry. 40・2. 524-530 (2001)
