2002 Fiscal Year Annual Research Report

生体高分子複雑系のナノカ学と工学操作

Research Project

Project/Area Number	11226202
Research Institution	Tokyo Institute of Technology
Principal Investigator	猪飼篤東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (50011713)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	長田俊哉東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (00201997) 大谷弘之東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助教授 (80203826) 田中信夫東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (50032024) 荒川秀雄東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 助手 (80211704)
Keywords	原始間力顕微鏡 / たんぱく質ナノ力学 / 炭酸デヒドラターゼ / カルモジュリン / 分子動力学 / ナノテクノロジー
Research Abstract	原子・分子のナノ力学の領域で、我々は生体高分子、特にタンパク質立体構造の力学的特質を明らかにする実験に従事し、タンパク質ナノ力学という新しい研究分野を開拓することに成功した.非常に複雑な原子間相互作用の上に成り立っているタンパク質の立体構造の幾何学的な解析はX-線結晶解析及びNMRによりなされているが、その構造が持つ力学的な固さ、あるいは固い部分と柔らかい部分の分子内分布については従来研究手段が無かった.我々は原子間力顕微鏡を使用することにより、単一タンパク質分子をその両末端から引き伸ばす実験に成功し、その延伸における張力と延伸距離の関係を詳細に調べる方法を確立した.この方法を炭酸デヒドラターゼおよびカルモジュリンという典型的な球状タンパク質に適用したところ、それぞれ分子内に外力による破壊に対してとりわけ耐性を持つ固い芯(コア)と言ってよい構造が存在することがわかった.炭酸デヒドラターゼでは全長の60-70%まで伸ばすと、このコア構造は協同現象的に破壊される.同様な構造破壊はカルモジュリンにおいても見ることができた.カルモジュリンについては、機能部位に結合するメリチンなどの低分子との相互作用によりその力学的性質が大きく変わることも確認した.同じタンパク質を生物機能を持たない状態にするとこのコア構造は失われる.原子間力顕微鏡による研究では張力と延伸距離の関係の情報以上は得られないので、並行して分子動力学シミュレーションによる研究を行った.その結果、炭酸デヒドラターゼにおけるコア構造はβシート構造によって構成され、亜鉛イオンの配位によって活性中心を作っている部分であることが強く示唆された.このような基礎的な力学物性に対する知見から、生体構造の複雑性を解明するさらに高次な研究への展開を目指している.

Research Products

(7 results)

All Other

All Publications (7 results)

[Publications] A.Idiris, M.T.Alam, A.Ikai: "Spring Mechanics of Alpha-Helical Polypeptide"Protein Engineering. 13. 763-770 (2000)
[Publications] H.Sekiguchi, H.Arakawa, T.Okajima, A.Ikai: "Non-destructive Force Measurement in Liquid Using Atomic Force Microscope"Applied Surface Science. 188. 489-492 (2002)
[Publications] R.Hertadi, A.Ikai: "Unfolding Mechanics of Holo and Apo Calmodulins studied by Atomic Force Microscope"Protein Science. 11. 1532-1538 (2002)
[Publications] M.T.Alam, T.Yamada, U.Carlsson, A.Ikai: "The importance of being knotted : effects of the C-terminal knot structure on enzymatic and mechanical properties of bovine carbonic anhydrase II"FEBS Lett.. 519. 35-40 (2002)
[Publications] Osada, T., Uehara, H., Kim, H., Ikai, A.: "mRNA analysis of single living cells"Journal of Nanobiotechnology. 1・2. 1-8 (2003)
[Publications] T.Okajima, H.Sekiguchi, H.Arakawa, A.Ikai: "Self-oscillation technique for AFM in liquids"Appl.Surf.Sci.. 210. 68-72 (2003)
[Publications] 日本表面学会: "ナノテクノロジーのための走査プローブ顕微鏡"丸善株式会社. 257 (2002)

2002 Fiscal Year Annual Research Report

生体高分子複雑系のナノカ学と工学操作

Principal Investigator

猪飼 篤 東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (50011713)

Research Products

[Publications] A.Idiris, M.T.Alam, A.Ikai: "Spring Mechanics of Alpha-Helical Polypeptide"Protein Engineering. 13. 763-770 (2000)

[Publications] H.Sekiguchi, H.Arakawa, T.Okajima, A.Ikai: "Non-destructive Force Measurement in Liquid Using Atomic Force Microscope"Applied Surface Science. 188. 489-492 (2002)

[Publications] R.Hertadi, A.Ikai: "Unfolding Mechanics of Holo and Apo Calmodulins studied by Atomic Force Microscope"Protein Science. 11. 1532-1538 (2002)

[Publications] M.T.Alam, T.Yamada, U.Carlsson, A.Ikai: "The importance of being knotted : effects of the C-terminal knot structure on enzymatic and mechanical properties of bovine carbonic anhydrase II"FEBS Lett.. 519. 35-40 (2002)

[Publications] Osada, T., Uehara, H., Kim, H., Ikai, A.: "mRNA analysis of single living cells"Journal of Nanobiotechnology. 1・2. 1-8 (2003)

[Publications] T.Okajima, H.Sekiguchi, H.Arakawa, A.Ikai: "Self-oscillation technique for AFM in liquids"Appl.Surf.Sci.. 210. 68-72 (2003)

[Publications] 日本表面学会: "ナノテクノロジーのための走査プローブ顕微鏡"丸善株式会社. 257 (2002)

猪飼篤東京工業大学, 大学院・生命理工学研究科, 教授 (50011713)