2000 Fiscal Year Annual Research Report
アブラナ科自家不和合性におけるS遺伝子座上遺伝子群の機能解明
Project/Area Number |
11238201
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Research Institution | Iwate University |
Principal Investigator |
渡辺 正夫 岩手大学, 農学部, 助教授 (90240522)
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Keywords | アブラナ科植物 / 自家不和合性 / SP11遺伝子 / SLG遺伝子 / 優劣性発現 / シロイヌナズナ / 遺伝子導入 / SRK遺伝子 |
Research Abstract |
Brassica SP遺伝子群とシロヌナズナゲノムsequenceとの相同性検索から、シロイヌナズナにおけるS遺伝子座対応領域のゲノムクローン(BAC;T12I7)を同定した。このT12I7の塩基配列を利用したSP遺伝子相同領域のクローニングを行うことにより、T12I7がConnerらの示したクローン(BAC;T1A8,6F5,2P16)の領域をカバーしていることを明らかにした。 2000年末にシロイヌナズナのゲノムsequenceが完成する過程において、T12I7のsequenceは前後4つのcontigに分割されて、遺伝子登録された。そこで、最終的な4つのcontigがカバーしている範囲についてORF予測を行い、SP遺伝子群の位置を確認した。シロイヌナズナとBrassica S9ハプロタイプの76kb sequenceを比較すると、SP3,SP4,SP8の遺伝子は、シロイヌナズナにおいてもtandemに並んでおり、その順序も両者で保存されていた。また、SP2,SLL2も同様であり、SP7と相同な遺伝子もシロイヌナズナに同定された。さらに、シロイヌナズナゲノムsequenceには、SAE1からSP6に対応する領域が欠失していた。この領域には、SLG,SRK,SP11を含む自家不和合性制御遺伝子を含んでおり、Connerらの主張するSLG,SRK対応領域の欠失を塩基レベルで確認するとともに、花粉側因子SP11の欠失も明らかにした。推定ORFの発現を確認するために、RT-PCR/Southern hybridizationを行った。その結果、発現量に多少の差異はあるが、LTPと相同性のあるF4N21-4を除いて、ほとんどのORFにおいて葉(栄養器官)と蕾(生殖器官)において発現が確認された。 さらに、T-DNA tag lineのscreeningの結果、AtSP3に1つ、AtSP8に3つのT-DNA insertion lineを確認した。挿入位置は、promoter領域、code領域のものもあった。
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[Publications] Watanabe,M.: "Genomic organization of SLG/SRK region on S locus in Brassica species."Annal.Bot.. 85(Suppl.A). 155-160 (2000)
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[Publications] 渡辺正夫: "アブラナ科自家不和合性の自他認識を制御するS遺伝子座-S遺伝子座のゲノム解析から花粉側S遺伝子の同定を目指して-"化学と生物. 38. 76-77 (2000)
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[Publications] Takasaki,T.: "SRK determines the S specificity of stigma in self-incompatible Brassica."Nature. 403. 913-916 (2000)
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[Publications] Suzuki,G.: "Physical distances between S-locus genes in various S haplotypes of Brassica rapa and B.oleracea."Theor.Appl.Genet.. 101. 80-85 (2000)
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[Publications] Watanabe M.: "Highly divergent sequences of the pollen self-incompatibility (S) gene in class-I S haplotypes of Brassica camtestris (syn.rapa)L."FEBS Lett.. 473. 139-144 (2000)
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[Publications] Takayama,S.: "The pollen determinant of self-incompatibility in Brassica campestris."Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 97. 1920-1925 (2000)