真核細胞ゲノム上の複製ドメイン・レプリコンの複製機序の解明

2000 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 11239204
• Research Institution: Mie University
• Principal Investigator: 奥村 克純 三重大学, 生物資源学部, 助教授 (30177183)
• Keywords: 出芽酵母 / レプリコン / DNAファイバー / FISH / DNA複製 / 動物細胞ゲノム

Research Abstract

本研究では、ゲノムDNAの複製進行過程・核内配置・クロマチン構造のダイナミクスの視覚化により、核内ゲノムのダイナミクスに関する情報の蓄積を目指す。
1.出芽酵母の初期複製開始部位をDNAファイバー上で検出する方法を考案した。ブロモデオキシウリジン(BrdU)を取り込むことができる出芽酵母をalphaファクターでG1期後期に同調し、ヒドロキシウレア(HU)、BrdU存在下でS期にリリースする。HUはヌクレオチドの供給を阻害するので、酵母細胞内のヌクレオチドプールが消費された時点で、S期の進行が停止する。この細胞からDNAファイバーを調製し、取り込まれたBrdUを蛍光抗体で検出するという方法で、検出された初期開始領域は平均6.9kbであった。アルカリショ糖密度勾配遠心で複製鎖を分離した結果、BrdUの取り込みはファイバーで検出されたサイズと同等のサイズの断片にのみ検出され、ファイバーで検出されたものが初期複製開始点を含むことを確認した。FISH法を利用して特定領域の複製開始部位を検討しつつある。BrdU標識されたフラグメントを濃縮し、DNAマイクロアレイに供し、初期複製開始点を網羅的にマップしたい。
2.動物細胞ゲノムのレプリコン解析法を開発した。付着系細胞にビオチン、及びジゴキシゲニン標識ヌクレオチドをビーズローディング法で導入した細胞からDNAファイバーを作製し、複製部位を蛍光検出すると、複製フォークの進行と近接する複製開始部位の存在が可視化できた。この方法により、真核細胞ゲノムのレプリコン構成に関するモデルを提示した。また、マウスメジャーサテライトDNA領域内の複製開始部位の検出に成功した。ゲノム上の特定部位の複製開始点をFISH法により解析中である。

Research Products

• [Publications] Masahiro Nogami: "Relative Locations of the Centromere and Imprinted SNRPN Gene within Chromosome 15 Territories During the Cell Cycle in HL60 Cells"Journal of Cell Science. 113巻12号. 2157-2165 (2000)
• [Publications] Hong-Seog Park: "Newly identified repeat sequences, derived from human chromosome 21qter, are also localized in the subtelomeric region of particular chromosomes and 2q13.and are conserved in the chimpanzee genome"FEBS Letters. 475巻3号. 167-169 (2000)
• [Publications] Masaki Ishida: "DNA Fluorescence In Situ Hybridization in Paramecium : Telomere Localization in Macronucleus"Zoological Science. 17巻. 1289-1295 (2000)
• [Publications] Keizo Yuasa: "Genomic Organization of the Human Phosphodiesterase PDE11A Gene : Evolutionary Relatedness with Other PDEs Containing GAF Domains"European Journal of Biochemistry. 268巻1号. 168-178 (2001)
• [Publications] Tomohiro Ishii: "Projection of Three Subsets of Olfactory Neurons Expressing the Odorant Receptor Transgene and the Two Cognate Endogenous Alleles"Genes to Cells. 6巻1号(印刷中). (2001)
• [Publications] Hideo Michibata: "Novel splice variants, genomic organization, their specific expression and chromosomal localization of the human Ca2+/calmodulin-dependent phosphodiesterase (PDE1A) gene"Biochimica Biophysica Acta. (印刷中). (2001)
• [Publications] Atsushi Kohda: "Visualization of Biallelic Expression of the Imprinted SNRPN Gene Induced by Inhibitors of DNA Methylation and Histone Deacetylation"Bioscience Biotechnology and Biochemistry. 65巻5号(印刷中). (2001)
• [Publications] Atsushi Kohda: "Preparation of Extended Metaphase Chromosomes from Human Cultured Cells Using a Topoisomerase II Inhibitor, ICRF-193"Bioscience Biotechnology and Biochemistry. 65巻5号(印刷中). (2001)