DNApooling法をもちいた関連研究による分裂病候補領域のゲノムスキャン

2000 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 11307014
• Research Institution: Teikyo University
• Principal Investigator: 南光 進一郎 帝京大学, 医学部, 教授 (60101127)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 徳永 勝士 東京大学, 医学系大学院, 教授 (40163977) ; 功刀 浩 帝京大学, 医学部, 講師 (40234471) ; 広瀬 徹也 帝京大学, 医学部, 教授 (10101742)
• Keywords: 精神分裂病 / ゲノムスキャン / 9番染色体 / デルタAIP / VLDLR / D9S15

Research Abstract

昨年度に引き続いて9番染色体動原体領域の12のマーカー(VLDLR,D9S273,D9S1822,D9s1837,D9S1876,D9S15,D9S927,D9S284,D9S1834,D9S1674,D9S153,D9S1843)について、DNAプーリング法を用いたゲノムスキャンをおこなった。
対象:DSM-IVによって分裂病と診断された100名と健常対照群100名
方法:おのおの100名ずつのDNAサンプルを約10ng/μlの濃度にする。オートメイティッドDNAシークエンサーのGENE SCANで得られたイメージをGENOTYPERで分析した。デルタAIPのP値はDaniels et al(Am.J.Hum Genet 1998)にしたがって計算した。すなわらデルタAIP=Dif/Dif+Com。VLDLRとD9S15については、患者群、対照群について個々に遺伝子型を分析・合計しカイ二乗検定によってP値を求める従来の方法もおこなった(プーリングのサンプルとは異なる)。
結果:すべてのマーカーにおいてデルタAIPのP値は、5%水準に達しなかった。D9S15のデルタAIP分析では偽陽性であったが、VLDLRとD9S15のデルタAIPのP値はカイ二乗検定によるP値より低かった。
結論:本研究によって9番染色体動原体の検索した領域では分裂病の候補領域としては除外されることが示された。またDNAプーリング法は、個々の遺伝子型分析に先立って、迅速な初期スクリーニングとして有効であることが示唆された。