DNApooling法をもちいた関連研究による分裂病候補領域のゲノムスキャン

2001 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 11307014
• Research Institution: Teikyo University
• Principal Investigator: 南光 進一郎 帝京大学, 医学部, 教授 (60101127)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 徳永 勝士 東京大学, 医学系大学院, 教授 (40163977) ; 功刀 浩 帝京大学, 医学部, 講師 (40234471) ; 広瀬 徹也 帝京大学, 医学部, 教授 (10101742)
• Keywords: 精神分裂病 / ゲノムスキャン / 1番染色体 / デルタAIP / プーリング

Research Abstract

昨年度は9番染色体動原体領域の12のマーカーについて、DNAプーリング法を用いたゲノムスキャンをおこなった。その結果、DNAプーリング法は、迅速な初期スクリーニングとして有効であることが示唆された。この結果にもとづいて本年度は1番染色体動原体領域の31のマーカーについてスキャンした。
対象:DSM-IVによって分裂病と診断された100名と健常対照群100名
方法:おのおの100名ずつのDNAサンプルを約10ng/μlの濃度にする。オートメイティッドDNAシークエンサーのGENE SCANで得られたイメージをGENOTYPERで分析した。デルタAIP値にもとづくP値はDaniels et al(Am.J.Hum Genet 1998)にしたがって計算した。すなわちデルタAIP=Dif/Dif+Comとした。
結果:31のマーカーのうち15のマーカーで結果が得られた。このうち5つのマーカーにおいてデルタAIPのP値は、5%水準に達しなかった。しかし残りの10のマーカーについては、デルタAIP値自体が大きくなった。その結果P値は、5%水準以下の有意差を示すことになった。これは偽陽性結果と考えられるので、その原因のうち可能性の高い測定法の問題を検討中である。