2000 Fiscal Year Annual Research Report
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11354011
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| Research Institution | National Institute of Genetics |
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Principal Investigator |
斎藤 成也 国立遺伝学研究所, 集団遺伝研究系, 助教授 (30192587)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
植田 信太郎 東京大学, 大学院・理学系, 助教授 (20143357)
五條堀 孝 国立遺伝学研究所, 生命情報センター, 教授 (50162136)
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| Keywords | ヒト化 / ゲノム / 進化 / 遺伝子 / 類人猿 / Silver |
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| Research Abstract |
本研究では、ヒト化を特徴づける遺伝子の変化を発見することを目的として、系統的にヒトに近縁な類人猿,特にチンパンジー(chimpanzee)、ゴリラ(gorilla)、オランウータン(orangutan)}の遺伝子の塩基配列の大規模比較を行なった。まず昨年度から進めていた研究だが,すでにDDBJ/EMBL/Genbank国際塩基配列データベースに登録されているヒトの塩基配列からプライマーを設計して、チンパンジー、ゴリラ、オランウータンからそれらの相同遺伝子の塩基配列決定を行なった。これには各生物種のゲノムDNAを鋳型として,PCRダイレクトシーケンス法を用いた。30遺伝子座、26kbずつ配列を決定し、分子進化学的解析を行った。その結果,これらの領域全体では,ヒトの系統で特異的に蓄積した塩基置換は全配列のうちの0.1%であると推定された。また,HoxAクラスターについて,PCRダイレクトシーケンス法を用いて合計で21kbづつの塩基配列をチンパンジー,ゴリラ,オランウータンで決定し,解析を行った。その結果,前半と後半では進化速度や系統関係について差が見いだされ,HoxAクラスターが全体としてまとまって進化してきているわけではないことが示唆された。ヒトと類人猿の塩基配列比較データベースの作成、およびそれらの大規模比較解析を行なっている。これらの結果は、類人猿ゲノム計画Silveのホームページ(http://sayer.lab.nig.ac.jp/〜silver/index.html)ですでに部分的に公開している。一方類人猿の種内変異の探索も重要なので,チンパンジーについては三和化学熊本霊長類パークと共同研究で血液資料の提供を受け,DNAを抽出して,mtDNAやMHCなどいくつかの遺伝子の塩基配列決定を行っている。
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[Publications] Yamamoto M.: "Murine equivalent of the human histo-blood group ABO gene is a cis-AB gene and encodes a glycosyltransferase with both A and B transferase activity"Journal of Biological Chemmistry. (in press).
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[Publications] Osawa M.: "Haplotype analysis of human alpha2-HS glycoprotein (fetuin)"Annals of Human Genetics. (in press).
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[Publications] Alan R.: "Genetic Diversity of the Human Serotonin Receptor 1B (HTR1B) Gene"Genomics. 72. 1-14 (2000)
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[Publications] Sumiyama K.: "Sequence variation in the ABO blood group gene exon 7 of chimpanzee and bonobo"Gene. 259. 75-79 (2000)
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[Publications] Noda R.: "Evolution of the ABO blood group gene in Japanese macaque"Genes and Genetic Systems. 75・3. 141-147 (2000)
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[Publications] Kitano T.: "Gene diversity of chimpanzee ABO blood group elucidated from intron 6 sequences"Journal of Heredity. 91・3. 211-214 (2000)
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[Publications] 斎藤成也: "ヒトと類人猿のゲノム比較から人間の独自性を探る.「特集:ゲノム研究から見た21世紀の生命科学」"細胞工学. 20・1. 65-69 (2001)
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[Publications] 斎藤成也: "特集:人類の起源と進化をDNAレベルで探る"蛋白質核酸酵素. 45・16. 2567-2570 (2000)
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[Publications] 斎藤成也: "類人猿ゲノム計画Silver.「特集:人類の起源と進化をDNAレベルで探る」"蛋白質核酸酵素. 45・16. 2604-2611 (2000)
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[Publications] 斎藤成也: "霊長類のゲノム計画"学術月報. 53・10. 1082-1086 (2000)
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[Publications] 野田令子: "チンパンジーとニホンザルにおけるABO式血液型遺伝子の進化"霊長類研究. 16・2. 157-167 (2000)
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[Publications] 斎藤成也: "類人猿ゲノム計画"霊長類研究. 16・2. 169-175 (2000)
