2000 Fiscal Year Annual Research Report
プロリンを重要成分として含む一次構造制御型ポリペプチドの三次元構造の解析
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11450373
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| Research Institution | Osaka Prefecture University |
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Principal Investigator |
林 壽郎 大阪府立大学, 先端科学研究所, 教授 (90026089)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
平野 義明 大阪工業大学, 工学部, 助教授 (80247874)
岡 勝仁 大阪府立大学, 先端科学研究所, 助教授 (70203966)
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| Keywords | プロリン / 周期性タンパク質 / 合成ポリペプチド / 三次元構造解析 / ヘリックス構造 / 核磁気共鳴スペクトル / 円偏光二色性 / 赤外吸収スペクトル |
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| Research Abstract |
本研究では、周期性タンパク質の反復アミノ酸配列部分の三次元構造を明らかにするために、その第一歩として反復アミノ酸配列部分をモデル化したポリペプチドの合成と、その三次元構造解析を遂行する。具体的には、プロリンを重要成分として含む種々の一次構造制御型ポリペプチドを合成し、それらの単一分子および会合体としての三次元構造の理論的、実験的解析を行うのが目的である。
1、プロリンを重要成分として含む一次構造制御型ポリペプチドの合成
前年度に引き続いて、周期性ポリペプチドpoly(Xaa-Pro)、poly(Xaa-Pro-Pro)、poly(Xaa-Pro-Pro-Pro)等について液相法と固相法を併用して合成を行った。Xaa残基については、側鎖原子団の疎水性、酸性、塩基性に着目して残基を選択した。疎水性残基として、Ala、Leu、ValおよびPheを、酸性残基としてGluを、塩基性残基としてLysを、それぞれ選択した。
2、プロリンを重要成分として含む一次構造制御型ポリペプチドの理論的構造解析
前年度と同様の手法により、分子力学計算に基づく構造最適化により、分子内相互作用の範囲で安定なヘリックス構造の集団に関するデータに基礎として、2分子、3分子からなる分子間会合体の構造最適化を試みた。それぞれの会合様式の相対的安定性に対する側鎖原子団の寄与についての役割をさらに明確にするために同様の解析を試みた。
3、プロリンを重要成分として含む一次構造制御型ポリペプチドの実験的構造解析
1で合成したポリペプチドの溶液状態でのCD、NMRおよびIR測定等データを集積した。溶媒系としては、各測定に対応して、水系、非水系を適当に選択し、濃度依存性、温度依存性、および塩濃度依存性について2の理論的構造解析の結果も含めた総合的な検討を加えた。
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[Publications] M.Hattori,M.Oka,T.Hayashi,Y.Hirano: "Synthesis and conformational analysis of model peptides having repetitive Xaa-Pro-Pro sequences"Peptide Science. 1999. 343-346 (2000)
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[Publications] M.Hattori,Y.Hirano,M.Oka,T.Hayashi: "Synthesis and conformational analysis of model polypeptides having repetitive Gly-Pro-Xaa sequences"Biomedical Material Res.Asia. 4. 150-151 (2000)
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[Publications] M.Oka,T.Hayashi: "Theoretical analysis of β-type super secondary structures constructed by β-strands"Peptides Science. 1999. 331-334 (2000)
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[Publications] M.Oka,T.Hayashi: "Theoretical analysis of α α β-type super secondary structures constructed by α-helices and β-strands"Peptides Science. 1999. 335-338 (2000)
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[Publications] M.Oka,M.Hattori,T.Hayashi,Y.Hirano: "Theoretical conformational analysis of the turn portion of tachyplesin I based on the Ala-residue approximation"Peptides Science. 1999. 339-342 (2000)
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[Publications] Y.Hirano,T.Iuchi,Y.Yamaguti,M.Oka,T.Hayashi: "Synthesis and evaluation of cell-attachment activity of RGDS mimetic peptides"Biomedical Material Res.Asia. 4. 108-109 (2000)
