1999 Fiscal Year Annual Research Report

広域ヌクレオチド解析に基づくヒト疾患原因遺伝子の究明と新しいモデルマウスの開発

Research Project

Project/Area Number	11470125
Research Category	Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
Research Institution	Tokai University
Principal Investigator	木村穣東海大学, 医学部, 教授 (10146706)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	佐藤正宏東海大学, 総合医学研究所, 助教授 (30287099) 猪子英俊東海大学, 医学部, 教授 (10101932)
Keywords	ヒト疾患 / ゲノム解析 / 疾患感受性遺伝子 / ベーテェット病 / 尋常性乾鮮 / トランスジェニックマウス / マイクロサテライト / SNP
Research Abstract	今年度は2疾患のモデルマウス開発の手がかりとして、尋常性乾癬候補領域のゲノムシークエンスを中心に報告する。これまで日本人の乾癬患者80人と健常人130人を用いて遺伝学的解析を行っていたが、ヒト第6染色体6p21.3のHLA-C遺伝子座からテロメア側200キロベース付近の2つのマイクロサテライトマーカーに挟まれた約50キロベースにわたる領域が乾癬患者群で共通しており、この領域が乾癬候補領域である可能性が示唆され(Oka A,et al.1999;Tamiya G,et al.unpiblished)。この候補領域およびテロメア側の約30キロベースにわたる領域を、乾癬患者13人と日本人健常者8人のゲノムDNAを用いてPCRを行い、内部プライマーを用いて直接塩基決定を行った。その結果、約300個のgSNPs(genomic SNPs)が見いだされ、そのハプロタイプの共有パターンから更に候補領域が約15キロベースに狭められた。一方、マイクロサテライトマーカーによって規定された候補領域50kbおよびその周辺には皮膚組織で発現する4つの新規遺伝子と一個の既知遺伝子(S遺伝子)が見いだされた。これらの遺伝子のエクソン上のcSNPs(coding SNPs)に関して、乾癬患者100人と健常者130人でその対立遺伝子頻度分布を調べて解析を行った結果、SEEK1と名づけた遺伝子のエクソン上の3つのcSNPsとS遺伝子上の1個のcSNPが統計的有意性を示した。また、これらのエクソンは、gSNPsによって規定された候補領域15キロベース中に存在することから乾癬候補遺伝子である可能性が高いと考えられる。現在、乾癬患者、健常人あわせ500人を解析中である。またベーチェット病に関しては候補遺伝子3種のトランスジェニックマウスを作製し解析中であるが、これは次年度にゆずる。計画は順調に進んでいると言える。

Research Products
(5 results)

All Other

All Publications (5 results)

[Publications] Yabuki,k. et al.: "Triplet Repeat Polymorphism in the MICA Gene in HLA-B27 Positive and Negative Caucasian Patients with Ankylosing Spondylitis"Human Immunology. 60. 83-86 (1999)
[Publications] Ando,A., et al.: "cDNA cloning,northern hybridization, and mapping analysis of a putative GDS-related protein gene at the centromic ends of the human and mouse MHC regions"Immunogentics. 49. 354-356 (1999)
[Publications] Ota,M., et al.: "The Clinical Region for Behcet Disease in the Human Major Histocpatibility Complex Is Reduced to a 46-kb Segment Centromeric of HLA-B,by Association Analysis Using Refined Microsatellite Mapping"Am.J.Hum.Genet.. 64. 1406-1410 (1999)
[Publications] Shiina,T et al.: "Molecular dynamics of MHC genesis unravelled by sequence analysis of the 1,796,938bp HLA class I region"Proc Natl. Aced. Sci U.S.A.. 96. 13282-13287 (1999)
[Publications] Oka,A., et al.: "Association analysis using refined microsatellite markers localizes a susceptibility loucus for psoriasis vulgaris within a 111kb segment teromeric to the HLA-C gene"Human Molec Genet.. 8. 2165-2170 (1999)

1999 Fiscal Year Annual Research Report

広域ヌクレオチド解析に基づくヒト疾患原因遺伝子の究明と新しいモデルマウスの開発

Principal Investigator

木村 穣 東海大学, 医学部, 教授 (10146706)

Research Products

[Publications] Yabuki,k. et al.: "Triplet Repeat Polymorphism in the MICA Gene in HLA-B27 Positive and Negative Caucasian Patients with Ankylosing Spondylitis"Human Immunology. 60. 83-86 (1999)

[Publications] Ando,A., et al.: "cDNA cloning,northern hybridization, and mapping analysis of a putative GDS-related protein gene at the centromic ends of the human and mouse MHC regions"Immunogentics. 49. 354-356 (1999)

[Publications] Ota,M., et al.: "The Clinical Region for Behcet Disease in the Human Major Histocpatibility Complex Is Reduced to a 46-kb Segment Centromeric of HLA-B,by Association Analysis Using Refined Microsatellite Mapping"Am.J.Hum.Genet.. 64. 1406-1410 (1999)

[Publications] Shiina,T et al.: "Molecular dynamics of MHC genesis unravelled by sequence analysis of the 1,796,938bp HLA class I region"Proc Natl. Aced. Sci U.S.A.. 96. 13282-13287 (1999)

[Publications] Oka,A., et al.: "Association analysis using refined microsatellite markers localizes a susceptibility loucus for psoriasis vulgaris within a 111kb segment teromeric to the HLA-C gene"Human Molec Genet.. 8. 2165-2170 (1999)

木村穣東海大学, 医学部, 教授 (10146706)